RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000310418.8

CLTB-201, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-201ENST00000310418 CCT3P49368 545 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 ZNF117Q03924 483 aa20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 TP53BP2Q13625 1128 aa20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 CDC73Q6P1J9 531 aa20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 STAC2Q6ZMT1 411 aa20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 C20orf204Q6ZNR8 217 aa20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 LILRA2Q8N149 483 aa20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 PSMA8Q8TAA3 256 aa20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 TCP10LQ8TDR4 215 aa20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 OSTF1Q92882 214 aa20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 C3orf30Q96M34 536 aa20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 KLHL15Q96M94 604 aa20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 ACTRT3Q9BYD9 372 aa20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 CXorf36Q9H7Y0 433 aa20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 ATAD3AQ9NVI7 634 aa20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 NUDT17P0C025 328 aa20.3■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 ARRB2P32121 409 aa20.3■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 EIF1P41567 113 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 LTBQ06643 244 aa20.3■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 FOXF1Q12946 379 aa20.3■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 SPDYE7PQ495Y7 208 aa20.3■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 C6orf136Q5SQH8 315 aa20.3■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 IL23RQ5VWK5 629 aa20.3■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 Q71RC1 249 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 ZNF527Q8NB42 609 aa20.3■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 OR56A1Q8NGH5 318 aa20.3■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 ADAMTS15Q8TE58 950 aa20.3■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 NUDT8Q8WV74 236 aa20.3■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 HOXD1Q9GZZ0 328 aa20.3■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.3■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 FANCFQ9NPI8 374 aa20.3■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 NPIPA7E9PJI5 369 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 C6orf47O95873 294 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 KRT16P08779 473 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 NPIPA8P0DM63 369 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 SHC1P29353 583 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 SFTPDP35247 375 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 SERPINB5P36952 375 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 CARD18P57730 90 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 IFFO1Q0D2I5 559 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 KLHL26Q53HC5 615 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 BEX5Q5H9J7 111 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 DCST2Q5T1A1 773 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 CBLN3Q6UW01 205 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 CLEC9AQ6UXN8 241 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 BEND4Q6ZU67 534 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 STK32CQ86UX6 486 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 NATD1Q8N6N6 113 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 FNDC5Q8NAU1 212 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 GPATCH2Q9NW75 528 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 KCNE3Q9Y6H6 103 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 NAV3Q8IVL0 2385 aa20.29■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 H3BNH8 94 aa20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 KLF4O43474 513 aa20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 OIP5O43482 229 aa20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 NUDT14O95848 222 aa20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 TUBBP07437 444 aa20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 ELK4P28324 431 aa20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 AGTR1P30556 359 aa20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 P2RX1P51575 399 aa20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 SFXN5Q8TD22 340 aa20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 ROBO4Q8WZ75 1007 aa20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 COQ8BQ96D53 544 aa20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 PERPQ96FX8 193 aa20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 C12orf49Q9H741 205 aa20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 ICAM5Q9UMF0 924 aa20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 CARD8Q9Y2G2 431 aa20.28■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 SOX30O94993 753 aa20.27■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 PRPS1L1P21108 318 aa20.27■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 ADH6P28332 368 aa20.27■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 PRSS57Q6UWY2 283 aa20.27■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 FBXO27Q8NI29 283 aa20.27■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa20.27■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 RNF128Q8TEB7 428 aa20.27■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 MOAP1Q96BY2 351 aa20.27■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 Q96MF0 132 aa20.27■□□□□ 0.84
CLTB-201ENST00000310418 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms