RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299468.11

PCMTD2-202, Transcript of protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PCMTD2, Length 1,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2-202ENST00000299468 HPGDP15428 266 aa20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 CREB1P16220 341 aa20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 CTBP2P56545 445 aa20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.875e-13■■□□□ 14
PCMTD2-202ENST00000299468 HBMQ6B0K9 141 aa20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 CBLN3Q6UW01 205 aa20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 P3H2Q8IVL5 708 aa20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 MISPQ8IVT2 679 aa20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 PSMA8Q8TAA3 256 aa20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 TCP10LQ8TDR4 215 aa20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 ROBO4Q8WZ75 1007 aa20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 CAVIN3Q969G5 261 aa20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 PIGTQ969N2 578 aa20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 CHMP6Q96FZ7 201 aa20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 PPP3R2Q96LZ3 170 aa20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 GPATCH2Q9NW75 528 aa20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa20.5■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 ZANQ9Y493 2812 aa20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 SYNGR4O95473 234 aa20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 C6orf47O95873 294 aa20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 AGTR1P30556 359 aa20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 SFTPDP35247 375 aa20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 NDUFAF6Q330K2 333 aa20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 C6orf136Q5SQH8 315 aa20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 CDC73Q6P1J9 531 aa20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 LILRA2Q8N149 483 aa20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 OSTF1Q92882 214 aa20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 KLHL15Q96M94 604 aa20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 SRXN1Q9BYN0 137 aa20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 HHATLQ9HCP6 504 aa20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 FN1P02751 2386 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 TMEM114B3SHH9 223 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 ARHGEF9O43307 516 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 PLAUP00749 431 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 NUDT17P0C025 328 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 FPR1P21462 350 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 MAPK1P28482 360 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 CCT3P49368 545 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 TP53BP2Q13625 1128 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 KLHL26Q53HC5 615 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 IL23RQ5VWK5 629 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 IGFBPL1Q8WX77 278 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 OR5P2Q8WZ92 322 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 COQ8BQ96D53 544 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 PERPQ96FX8 193 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 COX4I2Q96KJ9 171 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 Q96MF0 132 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 ACTRT3Q9BYD9 372 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 C12orf49Q9H741 205 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 ICAM5Q9UMF0 924 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 CARD8Q9Y2G2 431 aa20.48■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 FREM1Q5H8C1 2179 aa20.47■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 NPIPB9F8W1W9 429 aa20.47■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 NTN1O95631 604 aa20.47■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 HSPA4LO95757 839 aa20.47■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 ME2P23368 584 aa20.47■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 CARD18P57730 90 aa20.47■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa20.47■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 DCST2Q5T1A1 773 aa20.47■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 CLEC9AQ6UXN8 241 aa20.47■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 C20orf204Q6ZNR8 217 aa20.47■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 RIMKLAQ8IXN7 391 aa20.47■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 FBXO27Q8NI29 283 aa20.47■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 ABHD3Q8WU67 409 aa20.47■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 GLRX2Q9NS18 164 aa20.47■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.46■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 H7C1Q1 480 aa20.46■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 PPP3CBP16298 524 aa20.46■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 RPL3P39023 403 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 VSNL1P62760 191 aa20.46■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 ZNF844Q08AG5 666 aa20.46■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 FNDC5Q8NAU1 212 aa20.46■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 OR56A1Q8NGH5 318 aa20.46■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 OR5AK3PQ8NH89 298 aa20.46■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 RNF128Q8TEB7 428 aa20.46■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 ARSGQ96EG1 525 aa20.46■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 ACTR6Q9GZN1 396 aa20.46■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 COQ10BQ9H8M1 238 aa20.46■□□□□ 0.87
PCMTD2-202ENST00000299468 ZNF195O14628 629 aa20.45■□□□□ 0.86
PCMTD2-202ENST00000299468 LY6G6DO95868 133 aa20.45■□□□□ 0.86
PCMTD2-202ENST00000299468 TUBBP07437 444 aa20.45■□□□□ 0.86
PCMTD2-202ENST00000299468 ATP6V1C1P21283 382 aa20.45■□□□□ 0.86
PCMTD2-202ENST00000299468 ELK4P28324 431 aa20.45■□□□□ 0.86
PCMTD2-202ENST00000299468 EIF1P41567 113 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms