RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 NTSP30990 170 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 LCN1P31025 176 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SFTPDP35247 375 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF83P51522 516 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PSG6Q00889 435 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 TGFBR3Q03167 851 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 CHRNEQ04844 493 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 NPSR1Q6W5P4 371 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 DEF8Q6ZN54 512 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 RINLQ6ZS11 566 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 USP43Q70EL4 1123 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GALNT5Q7Z7M9 940 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM139Q8IV31 216 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTRT1Q8TDG2 376 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 HTRA1Q92743 480 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf159Q96HA4 380 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF681Q96N22 645 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 BCO1Q9HAY6 547 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MED17Q9NVC6 651 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 NTMQ9P121 344 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MCM8Q9UJA3 840 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GRID1Q9ULK0 1009 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF724A8MTY0 619 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 B4DSR2 109 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ALG1L2C9J202 215 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDT14O95848 222 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 WNT11O96014 354 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 OTCP00480 354 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT6AP02538 564 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 OPN1LWP04000 364 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT6BP04259 564 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 NGFRP08138 427 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GSTA2P09210 222 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 COX5AP20674 150 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ENPP1P22413 925 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT6CP48668 564 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 RAC3P60763 192 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 LGALS3BPQ08380 585 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXL1Q12952 345 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC29A2Q14542 456 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SPIN4Q56A73 249 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SGO1Q5FBB7 561 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 CYS1Q717R9 158 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF527Q8NB42 609 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 OR52N5Q8NH56 324 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFP90Q8TF47 636 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC9A6Q92581 669 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO17Q96EF6 278 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ASB6Q9NWX5 421 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC151A5D8V7 595 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF814B7Z6K7 855 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 B9A039 149 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR171O14626 319 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM24O75264 130 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 RAD51DO75771 328 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PDE5AO76074 875 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 VENTXO95231 258 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 NPIPA8P0DM63 369 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MTHFD2P13995 350 aa6.92□□□□□ -1.3
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