RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237380.11

MED28-201, Transcript of mediator complex subunit 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MED28, Length 10,868 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28-201ENST00000237380 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 SIAH2O43255 324 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 RTL8BQ17RB0 113 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 MORN1Q5T089 497 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 OR6C1Q96RD1 312 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 JAM3Q9BX67 310 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 CXorf21Q9HAI6 301 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 RDH14Q9HBH5 336 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 INIPQ9NRY2 104 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 CACNA1SQ13698 1873 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 IFNA17P01571 189 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 ORM1P02763 201 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 CD27P26842 260 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 CCL11P51671 97 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 SBSNQ6UWP8 590 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 LIPIQ6XZB0 460 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 HTRA1Q92743 480 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 EGFP01133 1207 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 SFTPDP35247 375 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 ZNF814B7Z6K7 855 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 ACVR1BP36896 505 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 C1orf61Q13536 156 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 OR4A16Q8NH70 328 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 INTS14Q96SY0 518 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 GAL3ST1Q99999 423 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 MMP27Q9H306 513 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 CROCCQ5TZA2 2017 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 M0R233 179 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 HTR3BO95264 441 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 CYC1P08574 325 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 DEFA5Q01523 94 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 CDONQ4KMG0 1287 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 SARDHQ9UL12 918 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 C4BP0C0L5 1744 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 C20orf202A1L168 122 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 ZNF732B4DXR9 585 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 SOCS2O14508 198 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 DSCR3O14972 297 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 MTX2O75431 263 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 CLDN8P56748 225 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 DEFB133Q30KQ1 61 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 OR52E2Q8NGJ4 325 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 C2orf78A6NCI8 922 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 FAM189A1O60320 539 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 CNIH1O95406 144 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 SYPL2Q5VXT5 272 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 BEST3Q8N1M1 668 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 FGF13Q92913 245 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 TECTBQ96PL2 329 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 MOKQ9UQ07 419 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 MEN1O00255 615 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 SDC3O75056 442 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 G6PDP11413 515 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 ZNF44P15621 663 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 PLPP6Q8IY26 295 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 SGK3Q96BR1 496 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 DTD2Q96FN9 168 aa6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
MED28-201ENST00000237380 PKP2Q99959 881 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms