RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 RNF128Q8TEB7 428 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 INTS14Q96SY0 518 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 SULT4A1Q9BR01 284 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 GNG12Q9UBI6 72 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 STEAP1Q9UHE8 339 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 NPIPA7E9PJI5 369 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 CLN5O75503 358 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 NPIPA8P0DM63 369 aa9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 CYB561P49447 251 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ERV3-1Q14264 604 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 GPR139Q6DWJ6 353 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM139Q8IV31 216 aa9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 OR5D14Q8NGL3 314 aa9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 APMAPQ9HDC9 416 aa9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 TRAV18A0A075B6X5 111 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 DNAJB6O75190 326 aa9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 SPHARQ15513 63 aa9.91□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 IER2Q9BTL4 223 aa9.91□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 PPLO60437 1756 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 LMO7Q8WWI1 1683 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 A8MXE2 369 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 SDHDO14521 159 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 SLC16A7O60669 478 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 SLC35A1P78382 337 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 SHHQ15465 462 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 PM20D1Q6GTS8 502 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 SCD5Q86SK9 330 aa9.91□□□□□ -0.82
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