RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025177.12

Trappc8-201, Transcript of Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Trappc8, Length 5,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Clec2gQ9D676 269 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dock1Q8BUR4 1865 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pcdh17E9PXF0 1157 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cdhr4H3BJZ2 783 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 NumblO08919 604 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 CtsdP18242 410 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Wnt3aP27467 352 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ido1P28776 407 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ppm1bP36993 390 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cd9P40240 226 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lrrn4P59383 733 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Csnk2bP67871 215 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cct3P80318 545 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Akap14Q3V0I7 536 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 UnklQ5FWH2 727 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Abcd2Q61285 741 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sidt1Q6AXF6 827 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Efr3aQ8BG67 819 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 4933430I17RikQ8BHW4 495 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Panx3Q8CEG0 392 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Taf6lQ8R2K4 616 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr352Q8VGJ9 315 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fitm1Q91V79 292 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 NelfcdQ922L6 591 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lingo1Q9D1T0 614 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ap3m1Q9JKC8 418 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 MeltfQ9R0R1 738 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Bpifb9bA2AJD1 591 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr1214A2ATG3 311 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Spin2fJ3QPU0 254 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Kcnu1O54982 1121 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 FiglaO55208 194 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Akap10O88845 662 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 P01798 113 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 ChrngP04760 519 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PrlP06879 226 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gsx1P31315 261 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tac1P41539 130 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 TstP52196 297 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Kcnab3P97382 249 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cnpy1Q4VAB4 94 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Bpifb9aQ80XI7 591 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc44a2Q8BY89 706 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tbc1d17Q8BYH7 645 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Spata33Q8C624 132 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr582Q8VGV9 319 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tssk3Q9D2E1 268 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Yipf5Q9EQQ2 257 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Aqp9Q9JJJ3 295 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tcf23Q9JLR5 209 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr1375A0A0N4SUP0 313 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 6330409D20RikA2AK85 162 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Eif2b3B1AUN2 452 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn2r57L7N269 863 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rgs7O54829 469 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gpr27O54897 379 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ctla4P09793 223 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ccdc153P0C7Q1 202 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tcea1P10711 301 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 AcheP21836 614 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Adamts15P59384 950 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ldb1P70662 411 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ccl21aP84444 133 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ccl21bP86792 133 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ccl21cP86793 133 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Glb1l2Q3UPY5 636 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 SnrpaQ62189 287 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Osgepl1Q6PEB4 414 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pou6f2Q8BJI4 691 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Aph1aQ8BVF7 265 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Stk-ps2Q8C0V7 499 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 AcppQ8CE08 381 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Thap1Q8CHW1 210 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Entpd8Q8K0L2 497 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Q99LU8 229 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr701Q9D3U9 316 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr937Q9EQB4 311 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 RhojQ9ER71 214 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Adam28Q9JLN6 793 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Wif1Q9WUA1 379 aa6.65□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm10424A0A0J9YVD0 481 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr839-ps1A0A1D5RMH6 312 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm9602J3QPD5 205 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Serpinf2Q61247 491 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ssxb3Q6XAS4 170 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 LcorQ6ZPI3 433 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Wipi2Q80W47 445 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Kiaa1456Q80WQ4 447 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cdk3Q80YP0 303 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc39a9Q8BFU1 308 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gsto2Q8K2Q2 248 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gjc3Q921C1 269 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ceacam2Q925P2 520 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Il23aQ9EQ14 196 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Plag1Q9QYE0 499 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Crlf3Q9Z2L7 442 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm15013V9GWY0 266 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Alpk2Q91ZB0 2144 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm45736A0A1B0GS18 427 aa6.64□□□□□ -1.35
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc9a6A1L3P4 702 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.4 ms