RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	GGN	Q86UU5	652 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	ARL8A	Q96BM9	186 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	KLHL15	Q96M94	604 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	TRMO	Q9BU70	441 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	GSX2	Q9BZM3	304 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	NGB	Q9NPG2	151 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	OXSM	Q9NWU1	459 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	FREM3	P0C091	2139 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	ITPR3	Q14573	2671 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIM64B	A6NI03	449 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	TMCC2	O75069	709 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	KCNK2	O95069	426 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM153B	P0C7A2	387 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	LINC00032	P0C843	101 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	ACP2	P11117	423 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	SDC1	P18827	310 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	KRT4	P19013	534 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	ATP5J2	P56134	94 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	GUSBP1	Q15486	140 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM153C	Q494X1	144 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	APOOL	Q6UXV4	268 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	LILRA2	Q8N149	483 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF614	Q8N883	585 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	OR4C3	Q8NH37	302 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	OSTF1	Q92882	214 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TARDBP-231	ENST00000639599	C7orf72	A4D263	438 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC7A1	P30825	629 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	DUSP5	Q16690	384 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	TRABD2A	Q86V40	505 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	MZB1	Q8WU39	189 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	MTERF3	Q96E29	417 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	BTBD2	Q9BX70	525 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	OR10A4	Q9H209	315 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	GIN1	Q9NXP7	522 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A1W2PQD3	144 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	HS3ST1	O14792	307 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	ADAMDEC1	O15204	470 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	CLOCK	O15516	846 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	TBX19	O60806	448 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIM13	O60858	407 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	FES	P07332	822 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	IL11	P20809	199 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	ELK4	P28324	431 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	AGTR1	P30556	359 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	CCR4	P51679	360 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	FOXF1	Q12946	379 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	TP53BP2	Q13625	1128 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	KIAA0040	Q15053	153 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF385B	Q569K4	471 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31

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