RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637100.1

CLN3-255, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-255ENST00000637100 KCNK2O95069 426 aa14.63□□□□□ -0.07
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CLN3-255ENST00000637100 SOD3P08294 240 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 ACP2P11117 423 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 ADH6P28332 368 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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CLN3-255ENST00000637100 GPR151Q8TDV0 419 aa14.63□□□□□ -0.07
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CLN3-255ENST00000637100 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 RNF115Q9Y4L5 304 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 ACTL7BQ9Y614 415 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 ABCA1O95477 2261 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 TNFSF11O14788 317 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 HSPA4LO95757 839 aa14.62□□□□□ -0.07
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CLN3-255ENST00000637100 ELK4P28324 431 aa14.62□□□□□ -0.07
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CLN3-255ENST00000637100 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 ZNF385BQ569K4 471 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 PDSS1Q5T2R2 415 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 HBMQ6B0K9 141 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.62□□□□□ -0.07
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CLN3-255ENST00000637100 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.62□□□□□ -0.07
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CLN3-255ENST00000637100 HSD17B8Q92506 261 aa14.62□□□□□ -0.07
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CLN3-255ENST00000637100 FIGNL1Q6PIW4 674 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 ZYG11AQ6WRX3 759 aa14.61□□□□□ -0.07
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CLN3-255ENST00000637100 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 IMPG1Q17R60 797 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 SLC25A53Q5H9E4 307 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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