RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MOCOS	Q96EN8	888 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CEP19	Q96LK0	163 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC22A4	Q9H015	551 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NIPAL2	Q9H841	368 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CLN6	Q9NWW5	311 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RAB23	Q9ULC3	237 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TIMM22	Q9Y584	194 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARL5A	Q9Y689	179 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SCN1A	P35498	2009 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTPRS	Q13332	1948 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525		H0YIV9	168 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GFY	I3L273	518 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HCRT	O43612	131 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HCN1	O60741	890 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TBX19	O60806	448 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PEX14	O75381	377 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KCNK5	O95279	499 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ADA	P00813	363 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MT-ND2	P03891	347 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TFPT	P0C1Z6	253 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR56A5	P0C7T3	313 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IL7R	P16871	459 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AMD1	P17707	334 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TSPAN8	P19075	237 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CD53	P19397	219 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C4BPB	P20851	252 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CPN2	P22792	545 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTPN6	P29350	595 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TGFBR2	P37173	567 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CASP3	P42574	277 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MLLT10	P55197	1068 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR2B6	P58173	313 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MGAT3	Q09327	533 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NFATC2	Q13469	925 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ASAH1	Q13510	395 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GPR18	Q14330	331 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GALNT3	Q14435	633 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GBX1	Q14549	363 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDK10	Q15131	360 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MICA	Q29983	383 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FRG2	Q64ET8	278 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IL31	Q6EBC2	164 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CES5A	Q6NT32	575 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GPR65	Q8IYL9	337 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	METTL4	Q8N3J2	472 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.26	□□□□□ -1.73

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