RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ROBO4Q8WZ75 1007 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 GIMAP5Q96F15 307 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO34Q9NWN3 711 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 G3V2L1 256 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 OVOL3O00110 214 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNK2O95069 426 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 NTN1O95631 604 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 SOD3P08294 240 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 PYGBP11216 843 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM5Q6NVV9 412 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 GABRG1Q8N1C3 465 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC16A11Q8NCK7 471 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD3Q8WU67 409 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 OSTF1Q92882 214 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL15Q96M94 604 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF115Q9Y4L5 304 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 CRCPO75575 148 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 GSTA1P08263 222 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ME2P23368 584 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 CD226Q15762 336 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP5Q16690 384 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 TFAP2EQ6VUC0 442 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ZYG11AQ6WRX3 759 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 FRMD7Q6ZUT3 714 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 SZRD1Q7Z422 152 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 LILRA2Q8N149 483 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP43Q8NFH3 380 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 STEAP2Q8NFT2 490 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ACMSDQ8TDX5 336 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF128Q8TEB7 428 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 NEUROG1Q92886 237 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 MS4A4EQ96PG1 132 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 SRXN1Q9BYN0 137 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 HHATLQ9HCP6 504 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 CLOCKO15516 846 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC22BO75396 215 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 DANCRP0C864 163 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 SFTPDP35247 375 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 PRIM2P49643 509 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXF1Q12946 379 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 NCMAPQ5T1S8 102 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 PDSS1Q5T2R2 415 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNJQ5T5M9 372 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 TRABD2AQ86V40 505 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP70Q8NHQ1 597 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 MZB1Q8WU39 189 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXW5Q969U6 566 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 NTMQ9P121 344 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 NPIPB8E9PQR5 432 aa22.82■■□□□ 1.24
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CAPNS1-211ENST00000590874 MYL2P10916 166 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 CDKN1AP38936 164 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 CARD18P57730 90 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TAB1Q15750 504 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF619Q8N2I2 560 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6Y1Q8NGX8 325 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFP28Q8NHY6 868 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC126Q96EE4 140 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf58Q96GQ5 468 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 REG4Q9BYZ8 158 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 UBQLN4Q9NRR5 601 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 RIPK2O43353 540 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 AKAP10O43572 662 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 HPGDP15428 266 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PRPH2P23942 346 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 FRKP42685 505 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ETFDHQ16134 617 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM201Q5SNT2 666 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 SFRP5Q5T4F7 317 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC6AQ6EIG7 209 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 MISPQ8IVT2 679 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TUSC5Q8IXB3 177 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PPCDCQ96CD2 204 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 HDHD5Q9BXW7 423 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL13Q9P2N7 655 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 DCDC2Q9UHG0 476 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PQD3 144 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BQF6 201 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 SCDO00767 359 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 EFNA2O43921 213 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 CD3EP07766 207 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 SDC1P18827 310 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 IL32P24001 234 aa22.8■■□□□ 1.24
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