RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590220.1

PIK3C3-213, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, human

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 168 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PIK3C3-213	ENST00000590220	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	TREM2	Q9NZC2	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	OARD1	Q9Y530	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	RYR1	P21817	5038 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	TAPBP	O15533	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	PLPP2	O43688	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	LIAS	O43766	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	RAD51D	O75771	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	OPN1MW	P04001	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	OR4A8	P0C604	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	OMG	P23515	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	PAX7	P23759	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	IL12B	P29460	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	RAB10	P61026	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	PRR5	P85299	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	RELB	Q01201	579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	CHRNE	Q04844	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	DUSP2	Q05923	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	CARM1	Q86X55	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNF675	Q8TD23	568 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	CHP1	Q99653	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	NPAS1	Q99742	590 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	OR51B5	Q9H339	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	HHATL	Q9HCP6	504 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	HERC2	O95714	4834 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220		A0A1W2PR80	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	CCDC188	H7C350	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	KLF11	O14901	512 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	SCO2	O43819	266 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	EFNA2	O43921	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	CYTIP	O60759	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	KERA	O60938	352 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	MPZL1	O95297	269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	IFNB1	P01574	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ITGA5	P08648	1049 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	CCDC175	P0C221	793 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	LYNX1	P0DP58	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ENPP1	P22413	925 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	COL8A2	P25067	703 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ELK4	P28324	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	KRT20	P35900	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	GP5	P40197	560 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	MAGEA6	P43360	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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