RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRAF6Q9Y4K3 522 aa25.31■■□□□ 1.64
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ALDH3A1P30838 453 aa25.3■■□□□ 1.64
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ACTRT2Q8TDY3 377 aa25.3■■□□□ 1.64
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LCN1P31025 176 aa25.29■■□□□ 1.64
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR2W6PQ8NHA6 318 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CAVIN3Q969G5 261 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ADGRG7Q96K78 797 aa25.29■■□□□ 1.64
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SNX8Q9Y5X2 465 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C7orf72A4D263 438 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TNFSF11O14788 317 aa25.28■■□□□ 1.64
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KLHDC3Q9BQ90 382 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GIN1Q9NXP7 522 aa25.27■■□□□ 1.64
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PDSS1Q5T2R2 415 aa25.26■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa25.26■■□□□ 1.63
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LAMP1P11279 417 aa25.25■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ATP6V1C1P21283 382 aa25.25■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C20orf204Q6ZNR8 217 aa25.25■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRABD2AQ86V40 505 aa25.25■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa25.25■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C1orf50Q9BV19 199 aa25.25■■□□□ 1.63
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FANCFQ9NPI8 374 aa25.25■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GLRX2Q9NS18 164 aa25.25■■□□□ 1.63
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