RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561304.5

ZEB1-223, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 1, human

TSL 1 (best)

Gene ZEB1, Length 1,383 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB1-223	ENST00000561304	FIG4	Q92562	907 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	SLC9A6	Q92581	669 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	GALNT8	Q9NY28	637 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	DSCAM	O60469	2012 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A1W2PNV4	684 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A1W2PPR1	153 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	OR2M5	A3KFT3	312 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304		F8W735	103 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304		H3BML4	177 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	SEC14L5	O43304	696 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	KCNK2	O95069	426 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ANGPTL1	O95841	491 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	IL18BP	O95998	194 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CHEK2	O96017	543 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	NPIPA8	P0DM63	369 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CCKAR	P32238	428 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	OPRM1	P35372	400 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	IST1	P53990	364 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	PRR5	P85299	388 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CD226	Q15762	336 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	EMB	Q6PCB8	327 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	AAGAB	Q6PD74	315 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	GGN	Q86UU5	652 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CDC20B	Q86Y33	519 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	MREG	Q8N565	214 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	OR4C3	Q8NH37	302 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	FAM110B	Q8TC76	370 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	SMPDL3B	Q92485	455 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CDS1	Q92903	461 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF524	Q96C55	264 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	TM9SF2	Q99805	663 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	RASSF1	Q9NS23	344 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	VDAC3	Q9Y277	283 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	NF1	P21359	2839 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	WDR91	A4D1P6	747 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	SLC22A20	A6NK97	555 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ALG1L2	C9J202	215 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	EMC8	O43402	210 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	KCNH1	O95259	989 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	C6orf47	O95873	294 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	PEPD	P12955	493 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	VAMP1	P23763	118 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	GCK	P35557	465 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CPOX	P36551	454 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	HPCAL1	P37235	193 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ASMT	P46597	345 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ART1	P52961	327 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	SIRPA	P78324	504 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	SORD	Q00796	357 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	MPP2	Q14168	576 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	MLC1	Q15049	377 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	POU4F3	Q15319	338 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	GUSBP1	Q15486	140 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	KRT71	Q3SY84	523 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	IL23R	Q5VWK5	629 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304		Q6ZS46	218 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		6.66	□□□□□ -1.34

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