RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 FBXO45P0C2W1 286 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 DDX5P17844 614 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 UGT2B10P36537 528 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TMED10P49755 219 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 LIM2P55344 173 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TGM3Q08188 693 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PDE7AQ13946 482 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 NTRK2Q16620 822 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 VPS26BQ4G0F5 336 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 BEX5Q5H9J7 111 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 DCST1Q5T197 706 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 NUDT13Q86X67 352 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 C9orf40Q8IXQ3 194 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 DEFB107AQ8IZN7 70 aa8.41□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 ZNF611Q8N823 705 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 RGMAQ96B86 450 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 COQ8BQ96D53 544 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 CSF3RQ99062 836 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 WDR41Q9HAD4 459 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PROK2Q9HC23 129 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SPAG4Q9NPE6 437 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM181Q9P2C4 612 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ATP6V1HQ9UI12 483 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 CLDN16Q9Y5I7 305 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 HEATR5AQ86XA9 2040 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PNV4 684 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 H0YHG0 523 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 GNB5O14775 395 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 HS3ST1O14792 307 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 CPN1P15169 458 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 CERS1P27544 350 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 BSGP35613 385 aa8.4□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 PSME3P61289 254 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ID2Q02363 134 aa8.4□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TIGD2Q4W5G0 525 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 LRIF1Q5T3J3 769 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 C6orf52Q5T4I8 152 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 LIPNQ5VXI9 398 aa8.4□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 DLEU7Q6UYE1 221 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 RNF111Q6ZNA4 994 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 RNF175Q8N4F7 328 aa8.4□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 OR1J4Q8NGS1 313 aa8.4□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 MS4A6EQ96DS6 147 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 TSSK3Q96PN8 268 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 KCNC2Q96PR1 638 aa8.4□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 ANGPTL4Q9BY76 406 aa8.4□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TAS2R7Q9NYW3 318 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 EHD3Q9NZN3 535 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SLC7A8Q9UHI5 535 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 CR1P17927 2039 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 A0A0A6YYD5 115 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 CYR61O00622 381 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 SCN2BO60939 215 aa8.39□□□□□ -1.07
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