RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559642.1

BMP4-208, Transcript of bone morphogenetic protein 4, human

TSL 3

Gene BMP4, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BMP4-208	ENST00000559642	CCDC115	Q96NT0	180 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BMP4-208	ENST00000559642	ZBTB18	Q99592	522 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BMP4-208	ENST00000559642	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BMP4-208	ENST00000559642	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BMP4-208	ENST00000559642	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BMP4-208	ENST00000559642	CALHM2	Q9HA72	323 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BMP4-208	ENST00000559642	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		11.65	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642		A0A1W2PQD3	144 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	DVL2	O14641	736 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	HCRTR2	O43614	444 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	GSN	P06396	782 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	PGR	P06401	933 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	OR12D1	P0DN82	309 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	PEPD	P12955	493 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	IDO1	P14902	403 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	DLX5	P56178	289 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	CLDN20	P56880	219 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	FOXF2	Q12947	444 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	SAXO2	Q658L1	398 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	MISP	Q8IVT2	679 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF527	Q8NB42	609 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	ARSG	Q96EG1	525 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	C7orf26	Q96N11	449 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	OR52E6	Q96RD3	313 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	PANX1	Q96RD7	426 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	SDF2	Q99470	211 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	RUBCNL	Q9H714	662 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	MED17	Q9NVC6	651 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	MAST4	O15021	2626 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	MED12L	Q86YW9	2145 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	CCDC154	A6NI56	674 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	UBD	O15205	165 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	FCMR	O60667	390 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	TGM6	O95932	706 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	CTSS	P25774	331 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	UQCRC1	P31930	480 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	KHK	P50053	298 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	ASCL1	P50553	236 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	ATP12A	P54707	1039 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	PPP2R2A	P63151	447 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	FUT5	Q11128	374 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	GPR68	Q15743	365 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	BCL2A1	Q16548	175 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	KLHL26	Q53HC5	615 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	CBLN3	Q6UW01	205 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	EPGN	Q6UW88	154 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	RNF130	Q86XS8	419 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	MEIOB	Q8N635	442 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	POC1B	Q8TC44	478 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	NEURL3	Q96EH8	262 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	RNF145	Q96MT1	663 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	EBF4	Q9BQW3	602 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	MKLN1	Q9UL63	735 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642		A0A087WZY1	265 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	SLC22A20	A6NK97	555 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BMP4-208	ENST00000559642	DUXA	A6NLW8	204 aa		11.62	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms