RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556374.5

ATXN3-241, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,083 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-241ENST00000556374 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 OR4K1Q8NGD4 311 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 OR4C15Q8NGM1 316 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 OR9A1PQ8NGU1 263 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 OR5AK3PQ8NH89 298 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 GRPEL2Q8TAA5 225 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 BBS10Q8TAM1 723 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TEX47Q8TBZ9 253 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 C16orf78Q8WTQ4 265 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 CHAC2Q8WUX2 184 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 OR5P2Q8WZ92 322 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 GGHQ92820 318 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 UFD1Q92890 307 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 MAL2Q969L2 176 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 WBP2Q969T9 261 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 NUS1Q96E22 293 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TMEM80Q96HE8 168 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 LRIG1Q96JA1 1093 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 C7orf34Q96L11 122 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 Q96MF0 132 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 AGAP4Q96P64 663 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SIGLEC11Q96RL6 698 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TIMP4Q99727 224 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 AIF1LQ9BQI0 150 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 RHNO1Q9BSD3 238 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 CNPPD1Q9BV87 410 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 FAIM2Q9BWQ8 316 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 CDCA4Q9BXL8 241 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 PCBD2Q9H0N5 130 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 OR51E2Q9H255 320 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 CHST8Q9H2A9 424 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 NEK6Q9HC98 313 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 A4GALTQ9NPC4 353 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SACM1LQ9NTJ5 587 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 GIMAP4Q9NUV9 329 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 NDUFAF4Q9P032 175 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 FOXJ2Q9P0K8 574 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TBC1D14Q9P2M4 693 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TRPC4Q9UBN4 977 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 AASSQ9UDR5 926 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SEC14L3Q9UDX4 400 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 PHF11Q9UIL8 331 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 ENTPD4Q9Y227 616 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 IGSF10Q6WRI0 2623 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 DOCK8Q8NF50 2099 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 A0A075B6Q4 140 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SLC5A10A0PJK1 596 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TSPAN11A1L157 253 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 HYKKA2RU49 373 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TMEM8BA6NDV4 472 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 GABRR3A8MPY1 467 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 CENPXA8MT69 81 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SAP18O00422 153 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 DSCR3O14972 297 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SCN2BO60939 215 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TMCC2O75069 709 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 GUCY1B2O75343 617 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 CSO75390 466 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 MFN2O95140 757 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 C1orf105O95561 183 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 GPANK1O95872 356 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 IL1AP01583 271 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 KLK1P06870 262 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 YES1P07947 543 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 IL3P08700 152 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SLC35G4P0C7Q5 338 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 NR2F1P10589 423 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 PRKAR1AP10644 381 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TYRP14679 529 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 POU2F1P14859 743 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 PTPN2P17706 415 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 WT1P19544 449 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 CD22P20273 847 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TNFRSF1BP20333 461 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 CHMP24386 653 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 ACVR2AP27037 513 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 CD6P30203 668 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TGFBR1P36897 503 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 HSD17B2P37059 387 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 MMP12P39900 470 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SSR2P43308 183 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 GPR1P46091 355 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 RPS5P46782 204 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 PER3P56645 1201 aa4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms