RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554698.5

SDR39U1-208, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 39U member 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene SDR39U1, Length 1,364 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDR39U1-208	ENST00000554698	CDK6	Q00534	326 aa		19.5	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRT72	Q14CN4	511 aa		19.5	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	CYP51A1	Q16850	503 aa		19.5	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	19.5	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF614	Q8N883	585 aa		19.5	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		19.5	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		19.5	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		19.5	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		19.5	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		19.5	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		19.5	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698		A0A1B0GVC2	190 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	SUSD5	O60279	629 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	PGM3	O95394	542 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	SRD5A2	P31213	254 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF117	Q03924	483 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	RBBP4	Q09028	425 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	ART3	Q13508	389 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	FGFBP1	Q14512	234 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	REEP3	Q6NUK4	255 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	TRIL	Q7L0X0	811 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	ATCAY	Q86WG3	371 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	OR10A6	Q8NH74	314 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	NFKBID	Q8NI38	313 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	BBS10	Q8TAM1	723 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	NIN	Q8N4C6	2090 aa		19.49	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	C5orf58	C9J3I9	102 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	OIP5	O43482	229 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	HCN1	O60741	890 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	TRAPPC6A	O75865	159 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	PDE9A	O76083	593 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	UBL4A	P11441	157 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	HSF1	Q00613	529 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	SCARB2	Q14108	478 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	19.48	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF264	O43296	627 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	HCRTR2	O43614	444 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZIC3	O60481	467 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	CSTA	P01040	98 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	NID1	P14543	1247 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	ETS2	P15036	469 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	DPP4	P27487	766 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	CPA2	P48052	419 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	KCNJ10	P78508	379 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	PLAUR	Q03405	335 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	SKP2	Q13309	424 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	TOMM20	Q15388	145 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	EIPR1	Q53HC9	387 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	CBLN3	Q6UW01	205 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	CMIP	Q8IY22	773 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	HIPK4	Q8NE63	616 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF583	Q96ND8	569 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	CMTM6	Q9NX76	183 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698		A0A1B0GTH9	108 aa		19.46	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	19.46	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	AQP7	O14520	342 aa		19.46	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	THBS1	P07996	1170 aa		19.46	■□□□□ 0.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	PGM1	P36871	562 aa		19.46	■□□□□ 0.71

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