RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 RTTNQ86VV8 2226 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 TTC36A6NLP5 189 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 E9PBE3 544 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 PRRG2O14669 202 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 UBDO15205 165 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SCO2O43819 266 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SCN2BO60939 215 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 KCNH1O95259 989 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 MAN2A2P49641 1150 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 AQP5P55064 265 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SNTA1Q13424 505 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 VPS26BQ4G0F5 336 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 GXYLT1Q4G148 440 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 CCNJQ5T5M9 372 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ANXA8L1Q5VT79 327 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 FBXW10Q5XX13 1052 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 TIGD3Q6B0B8 471 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ACAD11Q709F0 780 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 TRILQ7L0X0 811 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 C6orf120Q7Z4R8 191 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 MARCH3Q86UD3 253 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 WDSUB1Q8N9V3 476 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 VPS37AQ8NEZ2 397 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 OR56A1Q8NGH5 318 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 OR5M9Q8NGP3 310 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 PSMA8Q8TAA3 256 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 FAM57AQ8TBR7 257 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ADAMTS15Q8TE58 950 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 CDS1Q92903 461 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 TESCQ96BS2 214 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 NTNG2Q96CW9 530 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 TMEM41AQ96HV5 264 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 OR52E6Q96RD3 313 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ZBTB18Q99592 522 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SERHLQ9NQF3 203 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 DLL4Q9NR61 685 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ALKBH4Q9NXW9 302 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 B4GALT7Q9UBV7 327 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 MEMO1Q9Y316 297 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SLC6A5Q9Y345 797 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 STAB1Q9NY15 2570 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GVC2 190 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 GMFGO60234 142 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SUSD5O60279 629 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 FADS1O60427 444 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SLC22A3O75751 556 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 KCNK2O95069 426 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 UTS2O95399 124 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 TGDSO95455 350 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 IGHG3P01860 377 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 C1QCP02747 245 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 GSNP06396 782 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 PGRP06401 933 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 IDO1P14902 403 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 MATN1P21941 496 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 PTPN6P29350 595 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 EVI2BP34910 448 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 GAS1P54826 345 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 PSPHP78330 225 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 STX5Q13190 355 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 GSTA3Q16772 222 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 DPY19L1Q2PZI1 675 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 GRAMD1BQ3KR37 738 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 EIPR1Q53HC9 387 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 HSP90B2PQ58FF3 399 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 CDC73Q6P1J9 531 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ZNF585AQ6P3V2 769 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 APOOLQ6UXV4 268 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ZAR1Q86SH2 424 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 PLCZ1Q86YW0 608 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 COX18Q8N8Q8 333 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 OR5D16Q8NGK9 328 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 OR9I1Q8NGQ6 314 aa8.75□□□□□ -1.01
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