RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC22A10Q63ZE4 541 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 CBLN3Q6UW01 205 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 FKBP9P1Q75LS8 142 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF527Q8NB42 609 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 PSD4Q8NDX1 1056 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 DUSP19Q8WTR2 217 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 HOXD1Q9GZZ0 328 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 MUC13Q9H3R2 512 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 DEPPQ9NTK1 212 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 ADPRHL2Q9NX46 363 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF232Q9UNY5 417 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 CARD8Q9Y2G2 431 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 NDUFB5O43674 189 aa20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAM11O75078 769 aa20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC25A12O75746 678 aa20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 GUSBP08236 651 aa20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 DNASE1L1P49184 302 aa20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 SELENOWP63302 87 aa20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 LIN52Q52LA3 116 aa20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 SGCZQ96LD1 299 aa20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 IFT52Q9Y366 437 aa20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 ALG1L2C9J202 215 aa20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 CSTAP01040 98 aa20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 PRG2P13727 222 aa20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 GAS1P54826 345 aa20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 FGFBP1Q14512 234 aa20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 FNDC7Q5VTL7 733 aa20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 HAS2Q92819 552 aa20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 IFNA14P01570 189 aa20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 LINC00303Q3SY05 128 aa20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 CANT1Q8WVQ1 401 aa20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 DOHHQ9BU89 302 aa20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 AURKCQ9UQB9 309 aa20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 NTNG1Q9Y2I2 539 aa20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 CDHR4A6H8M9 788 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 PINLYPA6NC86 204 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 THBS1P07996 1170 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 PRKAR1BP31321 381 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 RYKP34925 604 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 RFC3P40938 356 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 ACTR3P61158 418 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 IGFL2Q6UWQ7 119 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 MDS2Q8NDY4 140 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 PYURFQ96I23 114 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 OSBPL11Q9BXB4 747 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 PINK1Q9BXM7 581 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 MFRPQ9BY79 579 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM15Q9C019 465 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 RPS6KA6Q9UK32 745 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 MKRN2OSH3BPM6 223 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 P04436 131 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 NGFRP08138 427 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 LCN1P31025 176 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 YAP1P46937 504 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF117Q03924 483 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 ADGRG5Q8IZF4 528 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 GOLM1Q8NBJ4 401 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF138Q8WVD3 245 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF524Q96C55 264 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 PRORYQ9H606 182 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 CTPS2Q9NRF8 586 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 MED11Q9P086 117 aa20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1-208ENST00000524325 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 GNB5O14775 395 aa20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 HCRTR2O43614 444 aa20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 LGI1O95970 557 aa20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 UBL4AP11441 157 aa20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 TNFSF10P50591 281 aa20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 CCR4P51679 360 aa20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 COL28A1Q2UY09 1125 aa20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 EID3Q8N140 333 aa20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 PYDC1Q8WXC3 89 aa20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 PROX1Q92786 737 aa20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 PMM1Q92871 262 aa20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 SACM1LQ9NTJ5 587 aa20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCG2Q9UNQ0 655 aa20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms