RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 EHFQ9NZC4 300 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 VPS18Q9P253 973 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 DEC1Q9P2X7 70 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 UVRAGQ9P2Y5 699 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 EPS15L1Q9UBC2 864 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPRR3Q9UBC9 169 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMED7Q9Y3B3 224 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZFHX3Q15911 3703 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 EYSQ5T1H1 3165 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 LTBP2Q14767 1821 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 PTPRTO14522 1441 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 CUBNO60494 3623 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC88CQ9P219 2028 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 PFASO15067 1338 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANKDD1BA6NHY2 528 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 E7EQL1 145 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 LGALS9O00182 355 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 TLR4O00206 839 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 XKRYO14609 159 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 FLRT2O43155 660 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 PEX14O75381 377 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 TNFSF13O75888 250 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 CELF2O95319 508 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC16A8O95907 504 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 TLX1NBP0CAT3 122 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 TCP1P17987 556 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 PSMA3P25788 255 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 GCKP35557 465 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 CXCL5P42830 114 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 FKBP1BP68106 108 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 PITPNAQ00169 270 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 MC1RQ01726 317 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPIBQ01892 262 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 GABPAQ06546 454 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 WASHC5Q12768 1159 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 GRB7Q14451 532 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 HEPACAMQ14CZ8 416 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPHARQ15513 63 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR1C1Q15619 314 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 CYP51A1Q16850 503 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM183BQ1AE95 376 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 PARP10Q53GL7 1025 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARMC4Q5T2S8 1044 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 STEAP1BQ6NZ63 245 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATRAIDQ6UW56 229 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 GRINAQ7Z429 371 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 ADM2Q7Z4H4 148 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 SNX32Q86XE0 403 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM183AQ8IXX5 376 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 LRRC52Q8N7C0 313 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 NPBQ8NG41 125 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 CKAP2Q8WWK9 683 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 BMFQ96LC9 184 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 CPXM1Q96SM3 734 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 SSX3Q99909 188 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR11A1Q9GZK7 315 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAGT1Q9H0U3 335 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 SGK2Q9HBY8 427 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 NRN1Q9NPD7 142 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 PNPLA3Q9NST1 481 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 AIG1Q9NVV5 245 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 LHX3Q9UBR4 397 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 DOCK9Q9BZ29 2069 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 CENPEQ02224 2701 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 STRCP1A6NGW2 1772 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 SH3PXD2BA1X283 911 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 H0YL77 283 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 PDLIM1O00151 329 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 TBX18O95935 607 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 PGK2P07205 417 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANKRD34CP0C6C1 535 aa-0.31□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms