RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-208ENST00000512193 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 PTH2RP49190 550 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 GDI2P50395 445 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 RPS25P62851 125 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 GPR19Q15760 415 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 NKG7Q16617 165 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 CCDC58Q4VC31 144 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 CYHR1Q6ZMK1 362 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TMEM156Q8N614 296 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 OR5T3Q8NGG3 340 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 OR2T4Q8NH00 348 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 SNAPC3Q92966 411 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 SERINC2Q96SA4 455 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 GLIPR2Q9H4G4 154 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 EPHA6Q9UF33 1036 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 DHDHQ9UQ10 334 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ALG5Q9Y673 324 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TVP23AA6NH52 213 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 HMX3A6NHT5 357 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 CPNE6O95741 557 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 CSTBP04080 98 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 CFIP05156 583 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 H2BFMP0C1H6 154 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 VEGFBP49765 207 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ERVK-25P63136 954 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 CTBSQ01459 385 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TSPAN31Q12999 210 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 LTB4RQ15722 352 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 PHF19Q5T6S3 580 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TMEM225Q6GV28 225 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 FAM111BQ6SJ93 734 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 RIMKLAQ8IXN7 391 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ZNF619Q8N2I2 560 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TMIEQ8NEW7 156 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 OR5K2Q8NHB8 316 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 SLC7A13Q8TCU3 470 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TM4SF18Q96CE8 201 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 POTEKPQ9BYX7 375 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 NTN4Q9HB63 628 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ASIC5Q9NY37 505 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 NUP50Q9UKX7 468 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 PRELID1Q9Y255 219 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 CCDC85CA6NKD9 419 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 F5H0A9 414 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 GABRPO00591 440 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 KIAA0355O15063 1070 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 RP2O75695 350 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 GIFP27352 417 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ZMYND11Q15326 602 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 INAVAQ3KP66 663 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 FAM71E1Q6IPT2 247 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 AVL9Q8NBF6 648 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 NEURL3Q96EH8 262 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 SLC6A7Q99884 636 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TPSD1Q9BZJ3 242 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TMEM185BQ9H7F4 350 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 OR6C2Q9NZP2 312 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 SPAG17Q6Q759 2223 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 A0A1W2PPL8 197 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 GFYI3L273 518 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 KCNJ13O60928 360 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 SCGB1D2O95969 90 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 THEGLP0DJG4 465 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 SLC1A3P43003 542 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 KCNJ5P48544 419 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 NSDHLQ15738 373 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TBC1D25Q3MII6 688 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 DCST2Q5T1A1 773 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 C1orf189Q5VU69 101 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 SLC22A10Q63ZE4 541 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ZNF584Q8IVC4 421 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 PRR22Q8IZ63 422 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms