RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	FGD3	Q5JSP0	725 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	PEX11G	Q96HA9	241 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	PRRC1	Q96M27	445 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	WDR54	Q9H977	334 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	IFT52	Q9Y366	437 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	PCSK5	Q92824	1860 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1W2PRQ8	180 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CCDC160	A6NGH7	325 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CTNS	O60931	367 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	UGT2B17	O75795	530 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ADA	P00813	363 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PAX7	P23759	505 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MAP4K2	Q12851	820 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	DGCR6	Q14129	220 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	LINC00471	Q8N535	108 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CRB3	Q9BUF7	120 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MASP2	O00187	686 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	OR10H2	O60403	315 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	COQ9	O75208	318 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SOX30	O94993	753 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	AK1	P00568	194 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	GAST	P01350	101 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CT62	P0C5K7	136 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	GSTT1	P30711	240 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MAP3K8	P41279	467 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	NPTX1	Q15818	432 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	VRK2	Q86Y07	508 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	EXTL1	Q92935	676 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SDF2	Q99470	211 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	UCK2	Q9BZX2	261 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SCN3B	Q9NY72	215 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	LHX6	Q9UPM6	363 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	WDR45	Q9Y484	360 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ATRX	P46100	2492 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	FCMR	O60667	390 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CBX7	O95931	251 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	FMO3	P31513	532 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	UGT2B15	P54855	530 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CSNK2B	P67870	215 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	TEK	Q02763	1124 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CHAF1B	Q13112	559 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PMS2P3	Q13401	168 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ATP1A4	Q13733	1029 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SEC23B	Q15437	767 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SPART	Q8N0X7	666 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	COX18	Q8N8Q8	333 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	DOK4	Q8TEW6	326 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PMM1	Q92871	262 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ZG16B	Q96DA0	208 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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