RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	CBFB	Q13951	182 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	GALNT10	Q86SR1	603 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	MIER2	Q8N344	545 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	GATS	Q8NAP1	163 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM110B	Q8TC76	370 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF138	Q8WVD3	245 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	NTNG2	Q96CW9	530 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	C14orf79	Q96F83	325 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	AIG1	Q9NVV5	245 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SDHD	O14521	159 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	RFXANK	O14593	260 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ZIC3	O60481	467 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TNFRSF21	O75509	655 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	RCBTB2	O95199	551 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CRH	P06850	196 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ADH7	P40394	386 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP3K8	P41279	467 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	KIR2DL3	P43628	341 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	STAR	P49675	285 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	LHX2	P50458	406 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	P2RX1	P51575	399 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CCR4	P51679	360 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TLE4	Q04727	773 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR68	Q15743	365 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	GPAT3	Q53EU6	434 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ARSK	Q6UWY0	536 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD46	Q86W74	232 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	OR4C3	Q8NH37	302 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM234	Q8WY98	164 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ITCH	Q96J02	903 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	C7orf26	Q96N11	449 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	UCN2	Q96RP3	112 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	OR51I1	Q9H343	314 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	POLE3	Q9NRF9	147 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	LIPT1	Q9Y234	373 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF175	Q9Y473	711 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR45	Q9Y484	360 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	NCKAP5	O14513	1909 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CACNA1D	Q01668	2161 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CACNA1C	Q13936	2221 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	OR2M5	A3KFT3	312 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC154	A6NI56	674 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CASK	O14936	926 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF264	O43296	627 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP7B1	O75881	506 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	IGKV1D-16	P01601	117 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	UBL4A	P11441	157 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ADH6	P28332	368 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEA8	P43361	318 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CTBP2	P56545	445 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CLDN18	P56856	261 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	UFM1	P61960	85 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	RAC1	P63000	192 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP2R2A	P63151	447 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	DCST1	Q5T197	706 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC115	Q96NT0	180 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SDF2	Q99470	211 aa		10.25	□□□□□ -0.77

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