RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494333.1

RIF1-211, Transcript of replication timing regulatory factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RIF1, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1-211ENST00000494333 REM1O75628 298 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 UROSP10746 265 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 GABRA1P14867 456 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 DDCP20711 480 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 GSTM5P46439 218 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 CDK9P50750 372 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 DCAF7P61962 342 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 SLC18A2Q05940 514 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 PLCXD2Q0VAA5 305 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 MST1LQ2TV78 715 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ZNF628Q5EBL2 1059 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 LIPMQ5VYY2 423 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 TIGD3Q6B0B8 471 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 CLEC6AQ6EIG7 209 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 C10orf107Q8IVU9 208 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ZNF675Q8TD23 568 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 HGDQ93099 445 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ARL8AQ96BM9 186 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 TMCO6Q96DC7 493 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 BBS4Q96RK4 519 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 NODALQ96S42 347 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 TIMP4Q99727 224 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 SENP1Q9P0U3 644 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 SLC6A5Q9Y345 797 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 FIS1Q9Y3D6 152 aa7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 FRG2CA6NGY1 282 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 AHRRA9YTQ3 701 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 TO15178 435 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ERN1O75460 977 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 TOXO94900 526 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 HPNP05981 417 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 CT45A8P0DMV1 189 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 CT45A9P0DMV2 189 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 KRT20P35900 424 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 PTGDSP41222 190 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.232e-10■□□□□ 10.9
RIF1-211ENST00000494333 VSNL1P62760 191 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 IFFO1Q0D2I5 559 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ZNF763Q0D2J5 394 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 PCLAFQ15004 111 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 KIAA0040Q15053 153 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 CEBPEQ15744 281 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 EIPR1Q53HC9 387 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 CT45A2Q5DJT8 189 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 FAM71E1Q6IPT2 247 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 NOXRED1Q6NXP6 359 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 FAM9CQ8IZT9 166 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 OR7G2Q8NG99 324 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 FAM76AQ8TAV0 307 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 TMBIM1Q969X1 311 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 NTNG2Q96CW9 530 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ERP27Q96DN0 273 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 TMEM41AQ96HV5 264 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 EGLN2Q96KS0 407 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ADOQ96SZ5 270 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 UBQLN3Q9H347 655 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 MIEF1Q9NQG6 463 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 TAS2R9Q9NYW1 312 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 KLRF1Q9NZS2 232 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 MID2Q9UJV3 735 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 PCNX1Q96RV3 2341 aa7.35□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 OR6C70A6NIJ9 312 aa7.34□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 MYO1GB0I1T2 1018 aa7.34□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 SLC28A1O00337 649 aa7.34□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 AZIN1O14977 448 aa7.34□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 RGS14O43566 566 aa7.34□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 PLOD3O60568 738 aa7.34□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 SPAG7O75391 227 aa7.34□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 CBR3O75828 277 aa7.34□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 EPPINO95925 133 aa7.34□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 GASTP01350 101 aa7.34□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 NUDT17P0C025 328 aa7.34□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 LINC00032P0C843 101 aa7.34□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 PTPN6P29350 595 aa7.34□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ALDH3A1P30838 453 aa7.34□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 SSTR2P30874 369 aa7.34□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 GZMKP49863 264 aa7.34□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 PNLIPRP2P54317 469 aa7.34□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 TFF3Q07654 80 aa7.34□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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