RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 SLC22A11Q9NSA0 550 aa20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 CTSFQ9UBX1 484 aa20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 KLF4O43474 513 aa20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 ENTPD6O75354 484 aa20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 DDAH2O95865 285 aa20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 CDK1P06493 297 aa20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 CDK5Q00535 292 aa20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 TRIM61Q5EBN2 209 aa20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 ACSM5Q6NUN0 579 aa20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 CASP12Q6UXS9 341 aa20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 SVOPQ8N4V2 548 aa20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 B3GNT7Q8NFL0 401 aa20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 OR8D4Q8NGM9 314 aa20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 NAT6Q93015 286 aa20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 MYDGFQ969H8 173 aa20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 CLN6Q9NWW5 311 aa20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 FBXO4Q9UKT5 387 aa20.1■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 SH3D21A4FU49 640 aa20.09■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 TTC36A6NLP5 189 aa20.09■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 TIAF1O95411 115 aa20.09■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 IGKV3-11P04433 115 aa20.09■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 GPR4P46093 362 aa20.09■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 RHBDD2Q6NTF9 364 aa20.09■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.09■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 COX15Q7KZN9 410 aa20.09■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa20.09■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 POGLUT1Q8NBL1 392 aa20.09■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 SLC38A9Q8NBW4 561 aa20.09■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 CEP76Q8TAP6 659 aa20.09■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 CCDC74BQ96LY2 380 aa20.09■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 OR6C1Q96RD1 312 aa20.09■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 VN1R1Q9GZP7 353 aa20.09■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 TVP23BQ9NYZ1 205 aa20.09■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa20.09■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.08■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 STSP08842 583 aa20.08■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 FPR3P25089 353 aa20.08■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 ATP12AP54707 1039 aa20.08■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 TMBIM6P55061 237 aa20.08■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 ACY1Q03154 408 aa20.08■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 NSDHLQ15738 373 aa20.08■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 TCEANCQ8N8B7 351 aa20.08■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 OR4C3Q8NH37 302 aa20.08■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 SLC2A12Q8TD20 617 aa20.08■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 ZNF721Q8TF20 911 aa20.08■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 PHOX2BQ99453 314 aa20.08■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 FUNDC2Q9BWH2 189 aa20.08■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 SRPK3Q9UPE1 567 aa20.08■□□□□ 0.81
USP13-202ENST00000482333 ARHGAP33O14559 1287 aa20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 PRKYO43930 277 aa20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 FOXL2P58012 376 aa20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 FGFBP1Q14512 234 aa20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 LPAL2Q16609 132 aa20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 TMEM201Q5SNT2 666 aa20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 OR8J1Q8NGP2 316 aa20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 IFI44Q8TCB0 444 aa20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 SLC46A1Q96NT5 459 aa20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 ZNF559Q9BR84 538 aa20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 SLC25A19Q9HC21 320 aa20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 FLRT3Q9NZU0 649 aa20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 MKL2Q9ULH7 1088 aa20.08■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 TRIM64BA6NI03 449 aa20.07■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 CER1O95813 267 aa20.07■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 LCKP06239 509 aa20.07■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 ADRA2AP08913 450 aa20.07■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 ST3GAL4Q11206 333 aa20.07■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 SLC23A3Q6PIS1 610 aa20.07■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 NUDT9Q9BW91 350 aa20.07■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 CDC42EP2O14613 210 aa20.06■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 CKMT1AP12532 417 aa20.06■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 RORAP35398 523 aa20.06■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 SLC15A1P46059 708 aa20.06■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 PCYT1AP49585 367 aa20.06■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 EFNB1P98172 346 aa20.06■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 PRR23CQ6ZRP0 262 aa20.06■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa20.06■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 TEX47Q8TBZ9 253 aa20.06■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 SMOC1Q9H4F8 434 aa20.06■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 EVA1AQ9H8M9 152 aa20.06■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 C14orf105Q9NVL8 296 aa20.06■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 DYRK3O43781 588 aa20.06■□□□□ 0.8
USP13-202ENST00000482333 PSMB9P28065 219 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms