RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481356.1

SRPRB-203, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 1,487 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-203ENST00000481356 UQCRC2P22695 453 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 IDH3AP50213 366 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 TFF3Q07654 80 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 C17orf67Q0P5P2 114 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 FUT5Q11128 374 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 GPR68Q15743 365 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 DPY19L1Q2PZI1 675 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 GTDC1Q4AE62 458 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 FLYWCH1Q4VC44 716 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 SAXO2Q658L1 398 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 ZNF527Q8NB42 609 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 LILRB4Q8NHJ6 448 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 RFWD2Q8NHY2 731 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 CKAP2Q8WWK9 683 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 CCDC115Q96NT0 180 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 SDF2Q99470 211 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 UBQLN4Q9NRR5 601 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 BTNL2Q9UIR0 455 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 MKLN1Q9UL63 735 aa10.01□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 CCDC154A6NI56 674 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 H3BNH8 94 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 FCMRO60667 390 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 SLC22A3O75751 556 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 SOX30O94993 753 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 IL2RAP01589 272 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 NGFRP08138 427 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 IDO1P14902 403 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 CPN1P15169 458 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 ZNF708P17019 499 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 BMP5P22003 454 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 ZNF136P52737 540 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 AQP5P55064 265 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 CLDN15P56746 228 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 CLDN20P56880 219 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 ZNF117Q03924 483 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 FOXF2Q12947 444 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 TIGD2Q4W5G0 525 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 COX20Q5RI15 118 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 PDZK1Q5T2W1 519 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 CBLN3Q6UW01 205 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 ZNF621Q6ZSS3 439 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 C16orf62Q7Z3J2 963 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 RNF130Q86XS8 419 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 LACC1Q8IV20 430 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 MCEMP1Q8IX19 187 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 XAGE5Q8WWM1 108 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 VPS33AQ96AX1 596 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 ZNF524Q96C55 264 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 LRRC46Q96FV0 321 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 PANX1Q96RD7 426 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 STOML1Q9UBI4 398 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 KCNE5Q9UJ90 142 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 CARD8Q9Y2G2 431 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 ABCA12Q86UK0 2595 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 ITPR2Q14571 2701 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 A0A1W2PQD3 144 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 DUXAA6NLW8 204 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 HSPB2A8KAH6 182 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 NPIPB9F8W1W9 429 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 HCRTR2O43614 444 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 TGM6O95932 706 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 IL11P20809 199 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 CHMP24386 653 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 KHKP50053 298 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 ATP12AP54707 1039 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 HPCAP84074 193 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 HSPB2Q16082 182 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 GSTA3Q16772 222 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 ATAD3BQ5T9A4 648 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 POMZP3Q6PJE2 187 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 SLC2A7Q6PXP3 512 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 GCNT2Q8N0V5 402 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 MIER2Q8N344 545 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 POC1BQ8TC44 478 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 ZPLD1Q8TCW7 415 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 FIG4Q92562 907 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 NEURL3Q96EH8 262 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-203ENST00000481356 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms