RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 GSK3AP49840 483 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PNLIPRP2P54317 469 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 GAS1P54826 345 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 CLDN15P56746 228 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 SRYQ05066 204 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 C2orf80Q0P641 193 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 EFR3AQ14156 821 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 BEX5Q5H9J7 111 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 CEP85LQ5SZL2 805 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 CLEC6AQ6EIG7 209 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 DNM1P46Q6ZS02 220 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PLCZ1Q86YW0 608 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 NUDCD3Q8IVD9 361 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PRR22Q8IZ63 422 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 SVOPQ8N4V2 548 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 OMA1Q96E52 524 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 BBS4Q96RK4 519 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PIGQQ9BRB3 760 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 MECRQ9BV79 373 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 EBPLQ9BY08 206 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ITPAQ9BY32 194 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 OR10A4Q9H209 315 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 REEP4Q9H6H4 257 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 SERHLQ9NQF3 203 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 GIN1Q9NXP7 522 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ATP6V1HQ9UI12 483 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ABCG2Q9UNQ0 655 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.88□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 SLC22A20A6NK97 555 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 HS3ST1O14792 307 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PIP5K1BO14986 540 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PDPK1O15530 556 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 TSPAN2O60636 221 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.318e-9■■■■■ 38.1
RBBP4-211ENST00000477563 CT45A8P0DMV1 189 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 CT45A9P0DMV2 189 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 BCKDHAP12694 445 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PEPDP12955 493 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 CREB1P16220 341 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 IL11P20809 199 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PRPS1L1P21108 318 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 TBXA2RP21731 343 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 THBS2P35442 1172 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 HPCAL1P37235 193 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 MAP3K8P41279 467 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 NR1H2P55055 460 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 DUSP2Q05923 314 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PLCXD2Q0VAA5 305 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 C6orf136Q5SQH8 315 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 OGFOD2Q6N063 350 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF550Q7Z398 422 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 OR7G2Q8NG99 324 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 OR2T11Q8NH01 316 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 TLCD1Q96CP7 247 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 TMCO6Q96DC7 493 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms