RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471538.1

SPEN-204, Transcript of spen family transcriptional repressor, humanhuman

TSL 2

Gene SPEN, Length 1,404 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEN-204ENST00000471538 CNIH4Q9P003 139 aa5.96□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 SLC13A4Q9UKG4 626 aa5.96□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 CDHR4A6H8M9 788 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 TGFBR3LH3BV60 316 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 SGK494L7N484 410 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 TAF4O00268 1085 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 PEX12O00623 359 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 CDC42EP2O14613 210 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 SURF4O15260 269 aa5.95□□□□□ -1.46
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SPEN-204ENST00000471538 FMO6PO60774 539 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 RDH16O75452 317 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 STX11O75558 287 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 RAB36O95755 333 aa5.95□□□□□ -1.46
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SPEN-204ENST00000471538 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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SPEN-204ENST00000471538 ALOX5P09917 674 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 SLC35E2P0CK97 266 aa5.95□□□□□ -1.46
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SPEN-204ENST00000471538 S1PR1P21453 382 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 NT5EP21589 574 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 TGM1P22735 817 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 CD40LGP29965 261 aa5.95□□□□□ -1.46
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SPEN-204ENST00000471538 SOX3P41225 446 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 CRYBB2P43320 205 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 FASLGP48023 281 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 ETV1P50549 477 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 PPP5CP53041 499 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 RAB40BQ12829 278 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 MAP4K2Q12851 820 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 ITGADQ13349 1161 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 FZD5Q13467 585 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 C1orf61Q13536 156 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 SNAPC1Q16533 368 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 PGGHGQ32M88 737 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 TUBA3EQ6PEY2 450 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 LYPD8Q6UX82 237 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 SLC36A4Q6YBV0 504 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 WDR88Q6ZMY6 472 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 ZAR1Q86SH2 424 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
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SPEN-204ENST00000471538 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 DTWD2Q8NBA8 298 aa5.95□□□□□ -1.46
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SPEN-204ENST00000471538 ZNF485Q8NCK3 441 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 TEX47Q8TBZ9 253 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 DOK4Q8TEW6 326 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 TMEM255BQ8WV15 326 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 PIK3R3Q92569 461 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 KLHDC7BQ96G42 594 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 ZNF649Q9BS31 505 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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SPEN-204ENST00000471538 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 MED17Q9NVC6 651 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 FBXO34Q9NWN3 711 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 FBXL21Q9UKT6 434 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 ZNF232Q9UNY5 417 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 CLDN16Q9Y5I7 305 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 CDH10Q9Y6N8 788 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 SPACA6W5XKT8 324 aa5.95□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 A0A075B6Q4 140 aa5.94□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa5.94□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 TMEM129A0AVI4 362 aa5.94□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 GXYLT2A0PJZ3 443 aa5.94□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 IRGMA1A4Y4 181 aa5.94□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 HYKKA2RU49 373 aa5.94□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 FUOMA2VDF0 154 aa5.94□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 TRAPPC13A5PLN9 417 aa5.94□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 LILRA5A6NI73 299 aa5.94□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 B4DGG1 531 aa5.94□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 J3QRE1 110 aa5.94□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 CHST10O43529 356 aa5.94□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 PFDN1O60925 122 aa5.94□□□□□ -1.46
SPEN-204ENST00000471538 COQ9O75208 318 aa5.94□□□□□ -1.46
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