RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471202.5

CHTF18-208, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, human

TSL 2

Gene CHTF18, Length 4,494 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHTF18-208	ENST00000471202	LBX1	P52954	281 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	SLC35A2	P78381	396 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	RPE65	Q16518	533 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	C1orf189	Q5VU69	101 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202		Q6ZNX1	250 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	LYSMD1	Q96S90	227 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	COPZ2	Q9P299	210 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	SDC3	O75056	442 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	HTR2B	P41595	481 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	INAVA	Q3KP66	663 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	RTL10	Q7L3V2	364 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	CCDC120	Q96HB5	630 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	VNN3	Q9NY84	501 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	ZNF208	O43345	1280 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	IFNA21	P01568	189 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	FBXO45	P0C2W1	286 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	RAB2A	P61019	212 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	SLC6A12	P48065	614 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	STEAP3	Q658P3	488 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	C18orf63	Q68DL7	685 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	ARL6	Q9H0F7	186 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	RASD1	Q9Y272	281 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	CPM	P14384	443 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	ALG10	Q5BKT4	473 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	TCTE1	Q5JU00	501 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	PMM1	Q92871	262 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	NXPE2	Q96DL1	559 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	C4orf36	Q96KX1	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202		A0A0J9YY10	115 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202		A8MVJ9	347 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	DUX1	O43812	170 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	GPR75	O95800	540 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	PSMB10	P40306	273 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	KCNJ5	P48544	419 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	S100A10	P60903	97 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	KCNJ10	P78508	379 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	GRK1	Q15835	563 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	COQ8A	Q8NI60	647 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	ABI3	Q9P2A4	366 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	PLPP1	O14494	284 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	F3	P13726	295 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	CLRN1	P58418	232 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	PRPS1	P60891	318 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	FGFBP1	Q14512	234 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHTF18-208	ENST00000471202	GBX1	Q14549	363 aa		13.59	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms