RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 RAET1LQ5VY80 246 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 PLXDC2Q6UX71 529 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 SZRD1Q7Z422 152 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 GALNT10Q86SR1 603 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 KIF18BQ86Y91 864 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 MISPQ8IVT2 679 aa11.92□□□□□ -0.5
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C9orf3-210ENST00000462125 MEIOBQ8N635 442 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 COX18Q8N8Q8 333 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 OR8J2Q8NGG1 315 aa11.92□□□□□ -0.5
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C9orf3-210ENST00000462125 OR5M1Q8NGP8 315 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 FBXO30Q8TB52 745 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 SFXN5Q8TD22 340 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 HOXD1Q9GZZ0 328 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 PIGMQ9H3S5 423 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 NEUROD4Q9HD90 331 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 CRIM1Q9NZV1 1036 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 SNX8Q9Y5X2 465 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 AKAP9Q99996 3911 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 C7orf72A4D263 438 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 H0YC42 278 aa11.91□□□□□ -0.5
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C9orf3-210ENST00000462125 ANKRD28O15084 1053 aa11.91□□□□□ -0.5
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C9orf3-210ENST00000462125 CCNJQ5T5M9 372 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 OR2A2Q6IF42 318 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 BHLHB9Q6PI77 547 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 CHMP1BQ7LBR1 199 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 CDH24Q86UP0 819 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 METTL25Q8N6Q8 603 aa11.91□□□□□ -0.5
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C9orf3-210ENST00000462125 CDS1Q92903 461 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 RASSF1Q9NS23 344 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF175Q9Y473 711 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 KCNE3Q9Y6H6 103 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 POLQO75417 2590 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1W2PNV4 684 aa11.9□□□□□ -0.5
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C9orf3-210ENST00000462125 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa11.9□□□□□ -0.5
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C9orf3-210ENST00000462125 ZNF17P17021 662 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 LBPP18428 481 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 CLDN20P56880 219 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 TP53BP2Q13625 1128 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 PGS1Q32NB8 556 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 AP1ARQ63HQ0 302 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 OR4F3Q6IEY1 312 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 OGFOD2Q6N063 350 aa11.9□□□□□ -0.5
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C9orf3-210ENST00000462125 TMEM200AQ86VY9 491 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 UBQLNLQ8IYU4 475 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 GCNT2Q8N0V5 402 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 CCDC197Q8NCU1 140 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 LRRC8CQ8TDW0 803 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 FIG4Q92562 907 aa11.9□□□□□ -0.5
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C9orf3-210ENST00000462125 ZBTB8AQ96BR9 441 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 TESCQ96BS2 214 aa11.9□□□□□ -0.5
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C9orf3-210ENST00000462125 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 RNF122Q9H9V4 155 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 MEAF6Q9HAF1 191 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 PNPOQ9NVS9 261 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf3-210ENST00000462125 STOML1Q9UBI4 398 aa11.9□□□□□ -0.5
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C9orf3-210ENST00000462125 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa11.89□□□□□ -0.51
C9orf3-210ENST00000462125 DUXAA6NLW8 204 aa11.89□□□□□ -0.51
C9orf3-210ENST00000462125 A6NNC1 897 aa11.89□□□□□ -0.51
C9orf3-210ENST00000462125 MSTNO14793 375 aa11.89□□□□□ -0.51
C9orf3-210ENST00000462125 ADAMDEC1O15204 470 aa11.89□□□□□ -0.51
C9orf3-210ENST00000462125 LINGO3P0C6S8 592 aa11.89□□□□□ -0.51
C9orf3-210ENST00000462125 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
C9orf3-210ENST00000462125 ATP12AP54707 1039 aa11.89□□□□□ -0.51
C9orf3-210ENST00000462125 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
C9orf3-210ENST00000462125 RAC1P63000 192 aa11.89□□□□□ -0.51
C9orf3-210ENST00000462125 PHC1P78364 1004 aa11.89□□□□□ -0.51
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