RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.56□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 MECRQ9BV79 373 aa7.56□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa7.56□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa7.56□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 MED17Q9NVC6 651 aa7.56□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 MKS1Q9NXB0 559 aa7.56□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1W2PQD3 144 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMIM23A6NLE4 172 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPIPB9F8W1W9 429 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 C16orf97H3BN30 126 aa7.55□□□□□ -1.2
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GAPDHP28-201ENST00000455134 CASKO14936 926 aa7.55□□□□□ -1.2
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GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM13O60858 407 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 LY6G6DO95868 133 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 OPN1LWP04000 364 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 NEFHP12036 1026 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 AGTR1P30556 359 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALDH3A1P30838 453 aa7.55□□□□□ -1.2
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GAPDHP28-201ENST00000455134 PRIM2P49643 509 aa7.55□□□□□ -1.2
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GAPDHP28-201ENST00000455134 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF117Q03924 483 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTGR1Q14914 329 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 MLC1Q15049 377 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACKR1Q16570 336 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 GALNTL6Q49A17 601 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 CFAP157Q5JU67 520 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 CBLN3Q6UW01 205 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHMP1BQ7LBR1 199 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRABD2AQ86V40 505 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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GAPDHP28-201ENST00000455134 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR7A2PQ8NGA2 310 aa7.55□□□□□ -1.2
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GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2W6PQ8NHA6 318 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSMA8Q8TAA3 256 aa7.55□□□□□ -1.2
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GAPDHP28-201ENST00000455134 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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GAPDHP28-201ENST00000455134 MTERF3Q96E29 417 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 C3orf30Q96M34 536 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q96MF0 132 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 MED18Q9BUE0 208 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 SRXN1Q9BYN0 137 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 SERHL2Q9H4I8 314 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM185BQ9H7F4 350 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 CXorf36Q9H7Y0 433 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 C3orf14Q9HBI5 128 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPATCH2Q9NW75 528 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF226Q9NYT6 803 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 SH3BP4Q9P0V3 963 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC17A7Q9P2U7 560 aa7.55□□□□□ -1.2
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GAPDHP28-201ENST00000455134 PROCRQ9UNN8 238 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNE3Q9Y6H6 103 aa7.55□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A087WZY1 265 aa7.54□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.54□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM64BA6NI03 449 aa7.54□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 ESPNB1AK53 854 aa7.54□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 H7C1Q1 480 aa7.54□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPHS1O60500 1241 aa7.54□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRCPO75575 148 aa7.54□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 NTN1O95631 604 aa7.54□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 HEXAP06865 529 aa7.54□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 LAMP1P11279 417 aa7.54□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 FCGR2AP12318 317 aa7.54□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 CREB1P16220 341 aa7.54□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPC1P35052 558 aa7.54□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 MANFP55145 182 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAC1P63000 192 aa7.54□□□□□ -1.2
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.54□□□□□ -1.2
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