RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454269.5

HCG18-240, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 2,430 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-240ENST00000454269 ITPAQ9BY32 194 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 PCDHAC1Q9H158 963 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 MIEF1Q9NQG6 463 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ATG4BQ9Y4P1 393 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 WDR81Q562E7 1941 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 A0A1B0GV72 72 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 A0A1W2PRV1 198 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 DHRS12A0PJE2 317 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 STBD1O95210 358 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 PPP3CBP16298 524 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ABOP16442 354 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 SRMP19623 302 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 FGF7P21781 194 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 PTPN3P26045 913 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 CSF2RBP32927 897 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 KHKP50053 298 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 EFNA3P52797 238 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 FOXM1Q08050 763 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 SREBF2Q12772 1141 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 TCEA2Q15560 299 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ZNF284Q2VY69 593 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 PYCR3Q53H96 274 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 OR52W1Q6IF63 320 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 RNF130Q86XS8 419 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 SP8Q8IXZ3 490 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 NAT16Q8N8M0 369 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 PXT1Q8NFP0 134 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 OR2T11Q8NH01 316 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ARRDC3Q96B67 414 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ARSGQ96EG1 525 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 FOXN4Q96NZ1 517 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 F2RL3Q96RI0 385 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 DIRC2Q96SL1 478 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ABCB8Q9NUT2 735 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 RASL12Q9NYN1 266 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ZNF222Q9UK12 451 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 RNF6Q9Y252 685 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 TPRKBQ9Y3C4 175 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 MEIKINA0A087WXM9 373 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 SUPT3HB4E1H0 165 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ANHXE9PGG2 379 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ACOT7O00154 380 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 NME2P1O60361 137 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 AP2A2O94973 939 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ITGA5P08648 1049 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 THRBP10828 461 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 TBPP20226 339 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 TGM3Q08188 693 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 CD47Q08722 323 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 PTPRCAPQ14761 206 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 TSTQ16762 297 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ZNF836Q6ZNA1 936 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 OR8J1Q8NGP2 316 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 CD200R1Q8TD46 325 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ADIPOR1Q96A54 375 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ULK4Q96C45 1275 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ORAI1Q96D31 301 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 SMIM8Q96KF7 97 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 TEX37Q96LM6 180 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ZIC5Q96T25 663 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 PHB2Q99623 299 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ELOVL1Q9BW60 279 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 PRR14Q9BWN1 585 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 BCO2Q9BYV7 579 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 RNF208Q9H0X6 261 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 PIGMQ9H3S5 423 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 IPPKQ9H8X2 491 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ADA2Q9NZK5 511 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 FBXL3Q9UKT7 428 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 NPTNQ9Y639 398 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 ALG6Q9Y672 507 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 MTCH2Q9Y6C9 303 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 C20orf202A1L168 122 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 RGS14O43566 566 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 PMP2P02689 132 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 SNHG28P0DPA3 235 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 EPHA1P21709 976 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-240ENST00000454269 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms