RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 RNFT2Q96EX2 444 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PRRX2Q99811 253 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10A4Q9H209 315 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 THSD1Q9NS62 852 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 HS3ST4Q9Y661 456 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 VWA8A3KMH1 1905 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6C68A6NDL8 312 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ACOD1A6NK06 481 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 EFCAB7A8K855 629 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 AGAP14A8MT82 685 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SCAMP1O15126 338 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SEMA7AO75326 666 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 HLA-DPB1P04440 258 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CRYBA1P05813 215 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 LPOP22079 712 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 MST1P26927 711 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PPM1AP35813 382 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 THPOP40225 353 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TTPAP49638 278 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 RGS4P49798 205 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC23BQ15437 767 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 BEND4Q6ZU67 534 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 L3MBTL4Q8NA19 623 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PXT1Q8NFP0 134 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 HMGB4Q8WW32 186 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 WNT2BQ93097 391 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PEX11GQ96HA9 241 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 FXYD6Q9H0Q3 95 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 NANSQ9NR45 359 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ENPP4Q9Y6X5 453 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBC2A0A5B9 178 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SH3BGRLO75368 114 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP3CBP16298 524 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 LAG3P18627 525 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PTGFRP43088 359 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 RFX3P48380 749 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 AKR1C2P52895 323 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 HMGA2P52926 109 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 E2F1Q01094 437 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 DHODHQ02127 395 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TAP2Q03519 686 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 AKR1C1Q04828 323 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ILKQ13418 452 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SCAMP5Q8TAC9 235 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 MTG2Q9H4K7 406 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ZSCAN32Q9NX65 697 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 RASD1Q9Y272 281 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0U1RQF3 1178 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM129A0AVI4 362 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAP00813 363 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00271P0C7V0 271 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CALCRP30988 508 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PGFP49763 221 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10A3P58181 314 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF235Q14590 738 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 GUCA2BQ16661 112 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SERPINA12Q8IW75 414 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT78Q8N1N4 520 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OR14A16Q8NHC5 309 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SMARCD1Q96GM5 515 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SUSD3Q96L08 255 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 HHIPQ96QV1 700 aa7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms