RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 MLC1Q15049 377 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 OR4C11Q6IEV9 310 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 OR8K5Q8NH50 307 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 MARK1Q9P0L2 795 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR34Q9UPC5 381 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 FKBP7Q9Y680 259 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 NUMA1Q14980 2115 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 CA3P07451 260 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 C8orf89P0DMQ9 161 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP6V1E1P36543 226 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 IFNGR2P38484 337 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 OMPP47874 163 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB14P61106 215 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ST3GAL2Q16842 350 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF311Q5JNZ3 666 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM46CQ5VWP2 391 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 PYHIN1Q6K0P9 492 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 RRM2BQ7LG56 351 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ARRDC3Q96B67 414 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ART5Q96L15 291 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 BBS4Q96RK4 519 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 EQTNQ9NQ60 294 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A0A6YYD5 115 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PPV9 198 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 PGRMC2O15173 223 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 CASC3O15234 703 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 HTR1FP30939 366 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 TAS2R38P59533 333 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SRP54P61011 504 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 GSG1Q2KHT4 349 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM44Q2T9K0 475 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 NKAIN4Q8IVV8 208 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC116Q8IYX3 515 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 OR5K2Q8NHB8 316 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 PINK1Q9BXM7 581 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 GSAPA4D1B5 854 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM183AA6NL82 134 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ERGP11308 486 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 OR10A3P58181 314 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAM2Q15035 370 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 HSD17B12Q53GQ0 312 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 TCEAL5Q5H9L2 206 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 C9orf50Q5SZB4 431 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM122CQ6P4D5 195 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 AMZ2Q86W34 360 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SIAH3Q8IW03 269 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SIRT6Q8N6T7 355 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 DIO2Q92813 273 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 RSPRY1Q96DX4 576 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 RADILQ96JH8 1075 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 MENTQ9BUN1 341 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 JAM3Q9BX67 310 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 CACNG6Q9BXT2 260 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL31Q9H511 634 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 CDCP1Q9H5V8 836 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 LIN7BQ9HAP6 207 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 KCMF1Q9P0J7 381 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SCML1Q9UN30 329 aa17.08■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A0C4DFX4 3053 aa17.08■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 C5orf67F2Z3F1 127 aa17.08■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 MAN2B1O00754 1011 aa17.08■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 SOCS6O14544 535 aa17.08■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 NTSP30990 170 aa17.08■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 SHC2P98077 582 aa17.08■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 BAMBIQ13145 260 aa17.08■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 SFXN4Q6P4A7 337 aa17.08■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF687Q8N1G0 1237 aa17.08■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 TOMM5Q8N4H5 51 aa17.08■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 MS4A15Q8N5U1 240 aa17.08■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 BEST4Q8NFU0 473 aa17.08■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 PPA2Q9H2U2 334 aa17.08■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 CHST2Q9Y4C5 530 aa17.08■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A0G2JPF8 293 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 C4orf51C9J302 202 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPAN4O14817 238 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 FZD7O75084 574 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 FGF19O95750 216 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 CD3GP09693 182 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 H2AFB2P0C5Z0 115 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 VIPR2P41587 438 aa17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.4 ms