RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ME2P23368 584 aa11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCAP28676 217 aa11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP3K8P41279 467 aa11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDSS1Q5T2R2 415 aa11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPTPQ5TA50 214 aa11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALKBH2Q6NS38 261 aa11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXOC3L1Q86VI1 746 aa11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP112Q8N8E3 955 aa11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDRT4Q8N9R6 151 aa11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4C3Q8NH37 302 aa11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POC1BQ8TC44 478 aa11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACTRT2Q8TDY3 377 aa11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF128Q8TEB7 428 aa11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFT81Q8WYA0 676 aa11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL15Q96M94 604 aa11.74□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TP53P04637 393 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DANCRP0C864 163 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPC1P35052 558 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IDUAP35475 653 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDKN1AP38936 164 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM201Q5SNT2 666 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCMAPQ5T1S8 102 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOXRED1Q6NXP6 359 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FIGNL1Q6PIW4 674 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFAP2EQ6VUC0 442 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM46Q7Z4K8 759 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZAR1Q86SH2 424 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRABD2AQ86V40 505 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MISPQ8IVT2 679 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GABRG1Q8N1C3 465 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO30Q8TB52 745 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABHD3Q8WU67 409 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ROBO4Q8WZ75 1007 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GIMAP5Q96F15 307 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MS4A4EQ96PG1 132 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 REG4Q9BYZ8 158 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO34Q9NWN3 711 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX8Q9Y5X2 465 aa11.73□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNK2O95069 426 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD3EP07766 207 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABHD2P08910 425 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACP2P11117 423 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL32P24001 234 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKAG1P54619 331 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSC22D1Q15714 1073 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAB1Q15750 504 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMBOX1Q6NT76 420 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SZRD1Q7Z422 152 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCNYL1Q8N7R7 359 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUP43Q8NFH3 380 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6Y1Q8NGX8 325 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP70Q8NHQ1 597 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFP28Q8NHY6 868 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM110BQ8TC76 370 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OSTF1Q92882 214 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EGLN2Q96KS0 407 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHDC3Q9BQ90 382 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HDHD5Q9BXW7 423 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 L2HGDHQ9H9P8 463 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRTM1Q9HBL6 345 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NGBQ9NPG2 151 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL13Q9P2N7 655 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCA1O95477 2261 aa11.72□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PP18 115 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PQD3 144 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF212BA8MTL3 300 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H3BQF6 201 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA8RI6L899 631 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCDO00767 359 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD5LO43866 347 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRCPO75575 148 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 URI1O94763 535 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLU7O95391 586 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSTA1P08263 222 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINGO3P0C6S8 592 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPGDP15428 266 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELK4P28324 431 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADH6P28332 368 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHC1P29353 583 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCN1P31025 176 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SFTPDP35247 375 aa11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms