RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 NMRK1Q9NWW6 199 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 DYSFO75923 2080 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 A0A087WV62 115 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 MYO1GB0I1T2 1018 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 H7C417 338 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 UPK1AO00322 258 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 PCDH7O60245 1069 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 JUNP05412 331 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 GSTA2P09210 222 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 HNF1AP20823 631 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 SPOCK1Q08629 439 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 GGTLC2Q14390 218 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 KLC3Q6P597 504 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 B3GLCTQ6Y288 498 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 FBXL14Q8N1E6 418 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 MUCL1Q96DR8 90 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF225Q9UK10 706 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 SNX6Q9UNH7 406 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA8OA6NCC3 632 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 VWC2LB2RUY7 222 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA8NF8WBI6 632 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA8RI6L899 631 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 STX16O14662 325 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 TCF21O43680 179 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA0513O60268 411 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 PRKD3O94806 890 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 PSMG1O95456 288 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 YES1P07947 543 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 ITGA2P17301 1181 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 ME2P23368 584 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 EDNRAP25101 427 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 GABRA3P34903 492 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 FABP6P51161 128 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 MANFP55145 182 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 CDH13P55290 713 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 SLC18A2Q05940 514 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 HEPACAMQ14CZ8 416 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 TIMM23BQ5SRD1 257 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 Q6ZT83 130 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 FCRLAQ7L513 359 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC91Q7Z6B0 441 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 TRABD2AQ86V40 505 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 RFLNBQ8N5W9 214 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 CDYL2Q8N8U2 506 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 OR4C3Q8NH37 302 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 PIK3R3Q92569 461 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 RADILQ96JH8 1075 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 DPH5Q9H2P9 285 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 POU2F3Q9UKI9 436 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa17.02■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa17.01■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ALG1L2C9J202 215 aa17.01■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 EFNA2O43921 213 aa17.01■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 OR4F21O95013 312 aa17.01■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP17.01■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 EFNA4P52798 201 aa17.01■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 SLC22A25Q6T423 547 aa17.01■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 CREG2Q8IUH2 290 aa17.01■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 APIPQ96GX9 242 aa17.01■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 VPS11Q9H270 941 aa17.01■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 GP6Q9HCN6 339 aa17.01■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa17■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 CSF3P09919 207 aa17■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 APEHP13798 732 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 TCP1P17987 556 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV1-2P23083 117 aa17■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 OR3A2P47893 321 aa17■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 CR1LQ2VPA4 569 aa17■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 OR2L13Q8N349 312 aa17■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ACTRT2Q8TDY3 377 aa17■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 C3orf49Q96BT1 292 aa17■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 EBPLQ9BY08 206 aa17■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 GLIPR2Q9H4G4 154 aa17■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 CXorf36Q9H7Y0 433 aa17■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 TIGARQ9NQ88 270 aa17■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 C9JVG2 144 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 MANBAO00462 879 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 KCNH1O95259 989 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 PGM3O95394 542 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 OTCP00480 354 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 TGFAP01135 160 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 RPS17P08708 135 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 LINGO3P0C6S8 592 aa16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms