RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397023.5

PPARG-208, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, human

TSL 5

Gene PPARG, Length 2,002 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPARG-208	ENST00000397023	SPATA2	Q9UM82	520 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023		A8MXK9	166 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	FLRT2	O43155	660 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	NDUFS4	O43181	175 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	NDUFA2	O43678	99 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	SULT1B1	O43704	296 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	RP2	O75695	350 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	RGS11	O94810	467 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	EPPIN	O95925	133 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	TF	P02787	698 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	CD1A	P06126	327 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	ASGR2	P07307	311 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	ELFN1	P0C7U0	828 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	GCGR	P47871	477 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	TPMT	P51580	245 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	CCR8	P51685	355 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	MAP2K6	P52564	334 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	REEP5	Q00765	189 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	FZD5	Q13467	585 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	GAS6	Q14393	721 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	RNF180	Q86T96	592 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	COMTD1	Q86VU5	262 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	CPO	Q8IVL8	374 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	SLC43A2	Q8N370	569 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	TTL	Q8NG68	377 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	FOXJ1	Q92949	421 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	ELP4	Q96EB1	424 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	KLHL15	Q96M94	604 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	C12orf66	Q96MD2	445 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	BBS4	Q96RK4	519 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	SLC22A12	Q96S37	553 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	REG4	Q9BYZ8	158 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	PLSCR5	A0PG75	271 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	HMSD	A8MTL9	139 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	AGRP	O00253	132 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	AGR2	O95994	175 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	IL5	P05113	134 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	CKM	P06732	381 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	CD3G	P09693	182 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	ERG	P11308	486 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	IFNGR1	P15260	489 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	ZP1	P60852	638 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	DGCR2	P98153	550 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF273	Q14593	569 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	INSL4	Q14641	139 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	ARL9	Q6T311	187 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023		Q6ZVU0	165 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	KAT2A	Q92830	837 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	WBP1	Q96G27	269 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	SFXN2	Q96NB2	322 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	MTG2	Q9H4K7	406 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	KCNK12	Q9HB15	430 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	KLHL1	Q9NR64	748 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	MED11	Q9P086	117 aa		9	□□□□□ -0.97
PPARG-208	ENST00000397023	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97

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