RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 TSPY10P0CW01 314 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 BCKDHAP12694 445 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 KRT13P13646 458 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 KIF5BP33176 963 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 RDXP35241 583 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 RPL4P36578 427 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 ACVR1BP36896 505 aa2.39□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 IL18R1Q13478 541 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 SPCS2Q15005 226 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 CAMK4Q16566 473 aa2.39□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 SLC25A24Q6NUK1 477 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 ARMCX2Q7L311 632 aa2.39□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 NANPQ8TBE9 248 aa2.39□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 C4orf36Q96KX1 117 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 SLC30A2Q9BRI3 323 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM121Q9BTD3 319 aa2.39□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 TM2D1Q9BX74 207 aa2.39□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP2.39□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 CYTH4Q9UIA0 394 aa2.39□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 HSCBQ8IWL3 235 aa2.38□□□□□ -2.03
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