RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 DTNBP1Q96EV8 351 aa13.51□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 TRIB1Q96RU8 372 aa13.51□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 TUBA1CQ9BQE3 449 aa13.51□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF350Q9GZX5 532 aa13.51□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 PTGES2Q9H7Z7 377 aa13.51□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 VDAC3Q9Y277 283 aa13.51□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 FAM234BA2RU67 622 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 OR2M5A3KFT3 312 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 DUXAA6NLW8 204 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 H0Y3Z8 333 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 H0YC42 278 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 HMGN4O00479 90 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 RFXANKO14593 260 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 FCMRO60667 390 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 SOX30O94993 753 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 AK1P00568 194 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 CPN1P15169 458 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF708P17019 499 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF117Q03924 483 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 GPR68Q15743 365 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 COX20Q5RI15 118 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 PDZK1Q5T2W1 519 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 AAGABQ6PD74 315 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 CBLN3Q6UW01 205 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ENPP6Q6UWR7 440 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 C16orf62Q7Z3J2 963 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 LACC1Q8IV20 430 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 FUNDC1Q8IVP5 155 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 TRIML2Q8N7C3 387 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF614Q8N883 585 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 LILRB4Q8NHJ6 448 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 EXD2Q9NVH0 621 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 MKLN1Q9UL63 735 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF337Q9Y3M9 751 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 H3BML4 177 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 HCRTR2O43614 444 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 KIAA0513O60268 411 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 CLDN15P56746 228 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 STX1BP61266 288 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 TFF3Q07654 80 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 LRRC74AQ0VAA2 488 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM44Q2T9K0 475 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 PLPPR5Q32ZL2 321 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 SLC2A7Q6PXP3 512 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 FRRS1Q6ZNA5 592 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 MISPQ8IVT2 679 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 UBQLNLQ8IYU4 475 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 C9orf106Q8NAJ2 232 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF527Q8NB42 609 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ZPLD1Q8TCW7 415 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ZFP90Q8TF47 636 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ARSGQ96EG1 525 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 PIGQQ9BRB3 760 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 NMUR2Q9GZQ4 415 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 HOXD1Q9GZZ0 328 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 NPHS2Q9NP85 383 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 MED17Q9NVC6 651 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 CLCF1Q9UBD9 225 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 DCTN4Q9UJW0 460 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 CARD8Q9Y2G2 431 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 DTNAQ9Y4J8 743 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 CD8B2A6NJW9 211 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 CLCA1A8K7I4 914 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 STX11O75558 287 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 UGT2B17O75795 530 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 CAPN3P20807 821 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 MSX1P28360 303 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF136P52737 540 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 MVDP53602 400 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 RCAN2Q14206 197 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF141Q15928 474 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 MAPK14Q16539 360 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 SYPL1Q16563 259 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ATAD3BQ5T9A4 648 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 HMGN2P46Q86SG4 172 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ANKFN1Q8N957 763 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 POC1BQ8TC44 478 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 STON2Q8WXE9 905 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 SMPDL3BQ92485 455 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 GTF2H4Q92759 462 aa13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms