RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 KCNE5Q9UJ90 142 aa27.1■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa27.1■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 PEX1O43933 1283 aa27.09■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 UGT2B17O75795 530 aa27.09■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 PDE9AO76083 593 aa27.09■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 TBXA2RP21731 343 aa27.09■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 TNFSF10P50591 281 aa27.09■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 TRIP10Q15642 601 aa27.09■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 BICRALQ6AI39 1079 aa27.09■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 ZADH2Q8N4Q0 377 aa27.09■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 PSD4Q8NDX1 1056 aa27.09■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 MDS2Q8NDY4 140 aa27.09■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 GRHL3Q8TE85 626 aa27.09■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 V9GYQ6 96 aa27.09■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 FADS1O60427 444 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A12O75746 678 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 EVI2BP34910 448 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 RPP38P78345 283 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 ATP6AP1Q15904 470 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 CYBRD1Q53TN4 286 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 FKBP9P1Q75LS8 142 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 PMM1Q92871 262 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 ADNPQ9H2P0 1102 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 METTL7AQ9H8H3 244 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 TUBD1Q9UJT1 453 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 SUV39H1O43463 412 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF682O95780 498 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 NGFRP08138 427 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 ETS2P15036 469 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 HPGDP15428 266 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 CASP3P42574 277 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 MAGEA2P43356 314 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 SELENOWP63302 87 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 MAPK14Q16539 360 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 PDZK1Q5T2W1 519 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 PRAMEF20Q5VT98 475 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 HMBOX1Q6NT76 420 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF527Q8NB42 609 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 POGLUT1Q8NBL1 392 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 CNIH4Q9P003 139 aa27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 AGAP5A6NIR3 686 aa27.07■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 SCDO00767 359 aa27.07■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 SEMG1P04279 462 aa27.07■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF141Q15928 474 aa27.07■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 APOOLQ6UXV4 268 aa27.07■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 KRT73Q86Y46 540 aa27.07■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF614Q8N883 585 aa27.07■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 LZICQ8WZA0 190 aa27.07■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF607Q96SK3 696 aa27.07■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 DOHHQ9BU89 302 aa27.07■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 HES7Q9BYE0 225 aa27.07■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 SACM1LQ9NTJ5 587 aa27.07■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 KLRF1Q9NZS2 232 aa27.07■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 ABCG2Q9UNQ0 655 aa27.07■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 PRAMEF25A6NGN4 478 aa27.06■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 M0QX08 132 aa27.06■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 P04436 131 aa27.06■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 ASB18Q6ZVZ8 466 aa27.06■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 PEX5LQ8IYB4 626 aa27.06■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 RNF138Q8WVD3 245 aa27.06■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 TAMM41Q96BW9 452 aa27.06■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa27.06■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 KLHL1Q9NR64 748 aa27.06■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 G3V3Y1 287 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 SCO2O43819 266 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 LDLRP01130 860 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 CD46P15529 392 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 PEX2P28328 305 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 KLHL26Q53HC5 615 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM81Q6P7N7 255 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 OR52P1PQ8NH57 321 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 RASSF5Q8WWW0 418 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 RTN4RQ9BZR6 473 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 KLHL4Q9C0H6 718 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 GALNT9Q9HCQ5 603 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 IL1RAPQ9NPH3 570 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 DTNAQ9Y4J8 743 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM229AB2RXF0 380 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 TPST1O60507 370 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 SP1P08047 785 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 IL7RP16871 459 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 PTGDSP41222 190 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A25Q6KCM7 469 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 MARCH3Q86UD3 253 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 VRK2Q86Y07 508 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 HSH2DQ96JZ2 352 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 C5orf34Q96MH7 638 aa27.05■■□□□ 1.92
ECHS1-201ENST00000368547 BDH2Q9BUT1 245 aa27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms