RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 OPRM1P35372 400 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PRIM2P49643 509 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 STARP49675 285 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 DGKQP52824 942 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 AQP5P55064 265 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TP53BP2Q13625 1128 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 LINC01559Q495D7 138 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 EPGNQ6UW88 154 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ARSKQ6UWY0 536 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 APOOLQ6UXV4 268 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZAR1Q86SH2 424 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MARCH3Q86UD3 253 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CDH24Q86UP0 819 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM200AQ86VY9 491 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RIMKLAQ8IXN7 391 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 UBQLNLQ8IYU4 475 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MIER2Q8N344 545 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OR8J2Q8NGG1 315 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SFXN5Q8TD22 340 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 NUDT8Q8WV74 236 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CDS1Q92903 461 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 COQ8BQ96D53 544 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CHMP6Q96FZ7 201 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TM9SF2Q99805 663 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 DUSP26Q9BV47 211 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 AIG1Q9NVV5 245 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 F8P00451 2351 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OR2M5A3KFT3 312 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SLC22A20A6NK97 555 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ALG1L2C9J202 215 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 E9PBE3 544 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 H3BML4 177 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 LINC01387J3KSC0 135 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SYT5O00445 386 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CFLARO15519 480 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SEC14L5O43304 696 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 HCRTR2O43614 444 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFB5O43674 189 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GMFGO60234 142 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SLC22A3O75751 556 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 C6orf47O95873 294 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 IL18BPO95998 194 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 IL6P05231 212 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PEPDP12955 493 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 HPGDP15428 266 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TBXA2RP21731 343 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 LCN1P31025 176 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 S100A3P33764 101 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SOAT1P35610 550 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PEX19P40855 299 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MDH1P40925 334 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MAGEA8P43361 318 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 KIR2DL3P43628 341 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CCT3P49368 545 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ATP4BP51164 291 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 DIO3P55073 304 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RIPPLY3P57055 190 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FOXF2Q12947 444 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 BCL2A1Q16548 175 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PGS1Q32NB8 556 aa6.92□□□□□ -1.3
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