RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359957.7

BRMS1-201, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BRMS1, Length 1,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-201ENST00000359957 WISP2O76076 250 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 RFPL3SP0C7P2 107 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 ACP2P11117 423 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 LCN1P31025 176 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 FXNQ16595 210 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 DUSP5Q16690 384 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 LRIF1Q5T3J3 769 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 LCN8Q6JVE9 175 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 ANKRD46Q86W74 232 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 PLCZ1Q86YW0 608 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 OR4K17Q8NGC6 315 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 C16orf58Q96GQ5 468 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 ITCHQ96J02 903 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 SLC35G5Q96KT7 338 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 ANKRD27Q96NW4 1050 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 INPP5KQ9BT40 448 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 MUC13Q9H3R2 512 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 ALG2Q9H553 416 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 RMND5AQ9H871 391 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 VAPAQ9P0L0 249 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 NINQ8N4C6 2090 aa13.34□□□□□ -0.27
BRMS1-201ENST00000359957 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 A0A1B0GVC2 190 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 GXYLT2A0PJZ3 443 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 C2orf72A6NCS6 295 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 AGR2O95994 175 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 LDLRP01130 860 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 HPNP05981 417 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 CELA3AP09093 270 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 MATN1P21941 496 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 UQCRC2P22695 453 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 HTR1EP28566 365 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 PTPN6P29350 595 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 MAP3K8P41279 467 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 SMSP52788 366 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 WNT3P56703 355 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 MTPNP58546 118 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 RUNDC3AQ59EK9 446 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 FIGNL1Q6PIW4 674 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 RPTNQ6XPR3 784 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 C6orf120Q7Z4R8 191 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 PQLC1Q8N2U9 271 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 NEIL3Q8TAT5 605 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 TRIM15Q9C019 465 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 PTGES2Q9H7Z7 377 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 SLC6A13Q9NSD5 602 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 EXD2Q9NVH0 621 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 ACTR3BQ9P1U1 418 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 BTNL2Q9UIR0 455 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 DKKL1Q9UK85 242 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 USP22Q9UPT9 525 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 LIPGQ9Y5X9 500 aa13.33□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 E9PLN8 166 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 SCDO00767 359 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 ARPC2O15144 300 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 SCN2BO60939 215 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 KCNK2O95069 426 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 UTS2O95399 124 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 AK1P00568 194 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 PTGDSP41222 190 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 TRPC1P48995 793 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 GTDC1Q4AE62 458 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 ATAD3BQ5T9A4 648 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 TMEM211Q6ICI0 200 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 CYP2R1Q6VVX0 501 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 DOLPP1Q86YN1 238 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 ZNF527Q8NB42 609 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 OR14L1PQ8NHC6 308 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 CDS1Q92903 461 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 SLCO4A1Q96BD0 722 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 CCDC115Q96NT0 180 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 VKORC1Q9BQB6 163 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 HOXD1Q9GZZ0 328 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 SLC6A15Q9H2J7 730 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 UBQLN3Q9H347 655 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 UBQLN4Q9NRR5 601 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 GPATCH2Q9NW75 528 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 EGFL7Q9UHF1 273 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 MEMO1Q9Y316 297 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 LRRC42Q9Y546 428 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 SNX13Q9Y5W8 968 aa13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 AQP12BA6NM10 295 aa13.31□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 RFXANKO14593 260 aa13.31□□□□□ -0.28
BRMS1-201ENST00000359957 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms