RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 TFECO14948 347 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 TMCC2O75069 709 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5F1O95221 314 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 SOX18P35713 384 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 LSSP48449 732 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 CDK10Q15131 360 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM44Q2T9K0 475 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 DEFB110Q30KQ9 67 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 PDZK1Q5T2W1 519 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 CDC73Q6P1J9 531 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF620Q6ZNG0 422 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 UTS2BQ765I0 119 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 VWA5B2Q8N398 1253 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFP41Q8N8Y5 198 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 LMAN1LQ9HAT1 526 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 SMIM30A4D0T7 59 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC182A6NF36 153 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 A8MV72 311 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 B4DXG7 233 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 P2RX6O15547 441 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 PGGHGQ32M88 737 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 DEFB134Q4QY38 66 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM255BQ8WV15 326 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC7A6Q92536 515 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CDS1Q92903 461 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 MS4A4EQ96PG1 132 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 PLA2G10O15496 165 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 DSG2Q14126 1118 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 TAF8Q7Z7C8 310 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CAMKK1Q8N5S9 505 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 KCMF1Q9P0J7 381 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CENPBD1B2RD01 187 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 PIP5K1CO60331 668 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 IGHA1P01876 353 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 THEGLP0DJG4 465 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 GAAP10253 952 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 AKT2P31751 481 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CAV3P56539 151 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 DAB2P98082 770 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ACSM1Q08AH1 577 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 NT5CQ8TCD5 201 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 DMRTB1Q96MA1 342 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SOSTQ9BQB4 213 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 TEX12Q9BXU0 123 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 NLGN3Q9NZ94 848 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CLCA2Q9UQC9 943 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 B4DGG1 531 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SCO2O43819 266 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 HTR1FP30939 366 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 TNFRSF17Q02223 184 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 BBS1Q8NFJ9 593 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF170Q96K19 258 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 EVA1BQ9NVM1 165 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CBLCQ9ULV8 474 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 A6NL46 340 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 AGR2O95994 175 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 RGS1Q08116 209 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ASPGQ86U10 573 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 GALNT12Q8IXK2 581 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2L13Q8N349 312 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 COQ7Q99807 217 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR45Q9Y484 360 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CDH10Q9Y6N8 788 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CDC42EP2O14613 210 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC2A10O95528 541 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 IL9P15248 144 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 MYL9P24844 172 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 KIR2DL3P43628 341 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA1024LP59773 190 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 PYDC2Q56P42 97 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXO42Q6P3S6 717 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC37A2Q8TED4 501 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 FRMD6Q96NE9 622 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF121Q9H920 327 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SCML1Q9UN30 329 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SMIM10L1P0DMW3 83 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CHRNB1P11230 501 aa17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms