RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM150BA6NC51 233 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM77I1YAP6 450 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 RGS13O14921 159 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 LAMTOR5O43504 91 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 HCKP08631 526 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ADH5P11766 374 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CD1DP15813 335 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MAKP20794 623 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MARCKSL1P49006 195 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 LCN6P62502 163 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 C14orf28Q4W4Y0 310 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 BCL2L15Q5TBC7 163 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF561Q8N587 486 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR56B1Q8NGI3 324 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 OR5W2Q8NH69 310 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 FOXJ1Q92949 421 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SUV39H2Q9H5I1 410 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MYOTQ9UBF9 498 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 MT-ND4LP03901 98 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ATXN8OSP0DMR3 200 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MGMTP16455 207 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 NMBRP28336 390 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PIGAP37287 484 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CAMLGP49069 296 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 GLO1Q04760 184 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MTFR2Q6P444 385 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 C11orf96Q7Z7L8 435 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR2L8Q8NGY9 312 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SH3RF2Q8TEC5 729 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MR1Q95460 341 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SIPA1Q96FS4 1042 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CXorf58Q96LI9 332 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CTRCQ99895 268 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 J3KR12 359 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ENPP3O14638 875 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 S1PR4O95977 384 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MT-ATP6P00846 226 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 NRLP54845 237 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PLP2Q04941 152 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 ITGB2P05107 769 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 THBS1P07996 1170 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ADRB1P08588 477 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 AMY2BP19961 511 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CNR1P21554 472 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 S100A11P31949 105 aa4.64□□□□□ -1.67
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