RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 ING3Q9NXR8 418 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 KCMF1Q9P0J7 381 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 EXTL2Q9UBQ6 330 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 IL20RAQ9UHF4 553 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 KLF15Q9UIH9 416 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1W2PP55 124 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 LINC01553A4QN01 128 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 FAM183AA6NL82 134 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 ARSBP15848 533 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 PRKCAP17252 672 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 TBXA2RP21731 343 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 GJA4P35212 333 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 IGFALSP35858 605 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 INPP1P49441 399 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 BTG1P62324 171 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 GALEQ14376 348 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 TRAM1Q15629 374 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 DUSP5Q16690 384 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 SNAP47Q5SQN1 464 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 ASPGQ86U10 573 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 HS6ST2Q96MM7 605 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 SDF2Q99470 211 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 ISM1B1AKI9 464 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 DVL2O14641 736 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 FMO6PO60774 539 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 CHRNB1P11230 501 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 THBS2P35442 1172 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 RAB25P57735 213 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 SPRED2Q7Z698 418 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM99Q8N816 258 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 CD180Q99467 661 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 SMIM10L1P0DMW3 83 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 HK1P19367 917 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 HTR2AP28223 471 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 SLC6A1P30531 599 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 RFX3P48380 749 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 ATP12AP54707 1039 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 SGCGQ13326 291 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 VITQ6UXI7 678 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 USP53Q70EK8 1073 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 AMIGO1Q86WK6 493 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 OR4K14Q8NGD5 310 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 SMIM10Q96HG1 83 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 SERINC2Q96SA4 455 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 PIGUQ9H490 435 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 FOLH1BQ9HBA9 442 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 CMC2Q9NRP2 79 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 SATB2Q9UPW6 733 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD1-201ENST00000331462 A0A0G2JMP0 313 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 A0A0X1KG70 313 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 SLC22A31A6NKX4 558 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 DBIP07108 87 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 MAKP20794 623 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 RUNX3Q13761 415 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 GARNL3Q5VVW2 1013 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 WDR88Q6ZMY6 472 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 OAFQ86UD1 273 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 TPRA1Q86W33 373 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF619Q8N2I2 560 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 OR4M2Q8NGB6 313 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM239Q8WW34 195 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 FAM131CQ96AQ9 280 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 DPH1Q9BZG8 443 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 PLPP2O43688 288 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 PLOD3O60568 738 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 CAPZA2P47755 286 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 TAS2R43P59537 309 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 IDNKQ5T6J7 187 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 FHL5Q5TD97 284 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 HACD4Q5VWC8 232 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 TM4SF19Q96DZ7 209 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 TWSG1Q9GZX9 223 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 WDR70Q9NW82 654 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM5Q9Y2B1 443 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 DOCK9Q9BZ29 2069 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 RFXAPO00287 272 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 RCBTB2O95199 551 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 MT-ND5P03915 603 aa20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms