RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 ANKRD54Q6NXT1 300 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 CDC73Q6P1J9 531 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 HSDL2Q6YN16 418 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 POGLUT1Q8NBL1 392 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 OR4K14Q8NGD5 310 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 UFD1Q92890 307 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 DIRAS2Q96HU8 199 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 SAMD8Q96LT4 415 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 WDFY2Q96P53 400 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 SLC35F4A4IF30 521 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 STK25O00506 426 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 SOCS6O14544 535 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 LDB3O75112 727 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 SLC35G6P0C7Q6 338 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 LAMP2P13473 410 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 HOXB2P14652 356 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 FPR3P25089 353 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 SNTA1Q13424 505 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 QSOX2Q6ZRP7 698 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF438Q7Z4V0 828 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 SFTPA2Q8IWL1 248 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 PATE1Q8WXA2 126 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 TMCO6Q96DC7 493 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 TMED9Q9BVK6 235 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 HDHD5Q9BXW7 423 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 ENKD1Q9H0I2 346 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 TBC1D17Q9HA65 648 aa15.24■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 GSAPA4D1B5 854 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 A8MUA0 341 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 SLC30A4O14863 429 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 KLF4O43474 513 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 RASGRP1O95267 797 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 ICAM2P13598 275 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 PVRP15151 417 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 UQCRC1P31930 480 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF620Q6ZNG0 422 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 GRPEL2Q8TAA5 225 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 OSTF1Q92882 214 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 FAM131CQ96AQ9 280 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 MSLNLQ96KJ4 702 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 SDF2Q99470 211 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 ADAP2Q9NPF8 381 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 GON4LQ3T8J9 2241 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 FABP12A6NFH5 140 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 DUXAA6NLW8 204 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 DVL2O14641 736 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 NCR1O76036 304 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF136P52737 540 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 FCRL6Q6DN72 434 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 WDR88Q6ZMY6 472 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 UBE2J2Q8N2K1 259 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 OR2L13Q8N349 312 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 CLDN22Q8N7P3 220 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 SNAPC3Q92966 411 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 ELSPBP1Q96BH3 223 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 BMFQ96LC9 184 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF649Q9BS31 505 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 BEX2Q9BXY8 128 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 PRRG3Q9BZD7 231 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 MMP28Q9H239 520 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 DAPP1Q9UN19 280 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 CLCA2Q9UQC9 943 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 SHISA3A0PJX4 238 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 TFECO14948 347 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 EGFP01133 1207 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 UGT2B7P16662 529 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 CELP19835 753 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 ACSL1P33121 698 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 STAT5AP42229 794 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 TNFRSF4P43489 277 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 PGGHGQ32M88 737 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 CPOQ8IVL8 374 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM52Q8NDY8 209 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 C7orf57Q8NEG2 295 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 NT5CQ8TCD5 201 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 TM4SF19Q96DZ7 209 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 MCOLN1Q9GZU1 580 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 MED20Q9H944 212 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 KCNE5Q9UJ90 142 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 CBLCQ9ULV8 474 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 PEX12O00623 359 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 GPR50Q13585 617 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 UBQLNLQ8IYU4 475 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 GJD3Q8N144 294 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 OR5T3Q8NGG3 340 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 DPH1Q9BZG8 443 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 ANKRD19PQ9H560 264 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 C20orf141Q9NUB4 165 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-201ENST00000325599 COMMD3Q9UBI1 195 aa15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms