RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304954.3

CSN3-201, Transcript of casein kappa, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSN3, Length 836 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3-201ENST00000304954 HTR2AP28223 471 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 PTGFRP43088 359 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 RPL29P47914 159 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 TRPC1P48995 793 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 CAMLGP49069 296 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 DIO3P55073 304 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 RPL8P62917 257 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 NDPQ00604 133 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 BCL2L1Q07817 233 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 RGS1Q08116 209 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 CEBPEQ15744 281 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 CFAP221Q4G0U5 840 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 SULT1C3Q6IMI6 304 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 DUSP16Q9BY84 665 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 NANSQ9NR45 359 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 AIPL1Q9NZN9 384 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 NYAP2Q9P242 653 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 WDR45Q9Y484 360 aa3.4□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 GSAPA4D1B5 854 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 BBOX1O75936 387 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 PPIAL4GP0DN37 164 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 SERPINA2P20848 420 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 ADORA2BP29275 332 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 ADRA1AP35348 466 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 KIR2DS2P43631 304 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 TRIP10Q15642 601 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 LRRC36Q1X8D7 754 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 TMEM17Q86X19 198 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 ZNF100Q8IYN0 542 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 C15orf54Q8N8G6 183 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 SELENOMQ8WWX9 145 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 PSMG2Q969U7 264 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 MYLPFQ96A32 169 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 C16orf74Q96GX8 76 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 NICN1Q9BSH3 213 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 GSDMCQ9BYG8 508 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 PTGES2Q9H7Z7 377 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 WDR76Q9H967 626 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 IL17CQ9P0M4 197 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 OR1A1Q9P1Q5 309 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 ABCG2Q9UNQ0 655 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 PPIAL4AQ9Y536 164 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 ARHGAP23Q9P227 1491 aa3.39□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 A0A087WZY1 265 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 K7ENP7 123 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 LATO43561 262 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 DUX1O43812 170 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 SCRG1O75711 98 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 UGT2B17O75795 530 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 IGLV1-47P01700 117 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 OPN1LWP04000 364 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 CSF2P04141 144 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 CALCBP10092 127 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 ZNF19P17023 458 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 OR3A4PP47883 348 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 STX17P56962 302 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 ZNF45Q02386 682 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 NDUFA9Q16795 377 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 TMEM41BQ5BJD5 291 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 LANCL3Q6ZV70 420 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 BBS1Q8NFJ9 593 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 SLC5A11Q8WWX8 675 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 NEIL2Q969S2 332 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 FAHD2AQ96GK7 314 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 IMMP1LQ96LU5 166 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 OR5B2Q96R09 309 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 TMEM121Q9BTD3 319 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 CAB39LQ9H9S4 337 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.38□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 LRRK1Q38SD2 2015 aa3.37□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 A0A0U1RQV5 110 aa3.37□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 A0A1W2PNV4 684 aa3.37□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 FAM74A7A6NL05 159 aa3.37□□□□□ -1.87
CSN3-201ENST00000304954 TRIM49D1C9J1S8 452 aa3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms