RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 TIMP2P16035 220 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SLC7A9P82251 487 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 TRNP1Q6NT89 227 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 PODNL1Q6PEZ8 512 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf58Q96GQ5 468 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ARPC5O15511 151 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 NT5C3BQ969T7 300 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 OR52D1Q9H346 318 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf105O95561 183 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 FOSL2P15408 326 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 KCNIP1Q9NZI2 227 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 HSFX1Q9UBD0 423 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 GGT3PA6NGU5 568 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 TTLL8A6PVC2 850 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 RGRP47804 291 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 CDK3Q00526 305 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 RHOXF1Q8NHV9 184 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 GGHQ92820 318 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SLC39A13Q96H72 371 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 BABAM2Q9NXR7 383 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS4O75173 837 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ARAFP10398 606 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 PGGHGQ32M88 737 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SPRED1Q7Z699 444 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D15Q8TC07 691 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SPTSSAQ969W0 71 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF649Q9BS31 505 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A5Q9Y345 797 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SLC2A5P22732 501 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SDR9C7Q8NEX9 313 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 OR52E1Q8NGJ3 308 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 FAM171A2A8MVW0 826 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 MMP2P08253 660 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 AKAIN1P0CW23 69 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 AKR1C2P52895 323 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ACY1Q03154 408 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 INTS14Q96SY0 518 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 DNTTIP1Q9H147 329 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 GDE1Q9NZC3 331 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf105B2RV13 164 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ACP2P11117 423 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 AGAP6Q5VW22 663 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 RTL10Q7L3V2 364 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 CDS1Q92903 461 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 AGAP4Q96P64 663 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0G2JNG1 304 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 MEIOCA2RUB1 952 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 KIR2DS3K7RE56 304 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 RPS15P62841 145 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 DSC1Q08554 894 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 KIR2DS5Q14953 304 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SLC5A12Q1EHB4 618 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ARL11Q969Q4 196 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 MYADMQ96S97 322 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 DCDC2BA2VCK2 349 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SEC14L5O43304 696 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 TFAP2AP05549 437 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 GIPRP48546 466 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 MLC1Q15049 377 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 AADACL4Q5VUY2 407 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 RETREG3Q86VR2 466 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SPIN2AQ99865 258 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 NAV1Q8NEY1 1877 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 LSMEM2Q8N112 164 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 CASD1Q96PB1 797 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM29Q9UKF5 820 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 RDH16O75452 317 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO45P0C2W1 286 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 TNFSF8P32971 234 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 NKPD1Q17RQ9 610 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ELP2Q6IA86 826 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 IL22RA1Q8N6P7 574 aa19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms