RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 MGLLQ99685 303 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 DUSP26Q9BV47 211 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 MIEF1Q9NQG6 463 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 FBXW2Q9UKT8 454 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ALG5Q9Y673 324 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 SLC22A7Q9Y694 548 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 SPTBP11277 2137 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF860A6NHJ4 632 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 DNAJB6O75190 326 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 CSF3P09919 207 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ALAS2P22557 587 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 NBL1P41271 181 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 PLET1Q6UQ28 207 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF621Q6ZSS3 439 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF605Q86T29 641 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 GLCCI1Q86VQ1 547 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 KRT73Q86Y46 540 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 RCBTB1Q8NDN9 531 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 TPD52L3Q96J77 140 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 PCP4L1A6NKN8 68 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 H3BMH7 237 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 SCN2BO60939 215 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 SEMG1P04279 462 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD34CP0C6C1 535 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 TNNI3P19429 210 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ALDH9A1P49189 494 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 HEPACAMQ14CZ8 416 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ATCAYQ86WG3 371 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 OR8H3Q8N146 312 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 GALNT11Q8NCW6 608 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 MTERF3Q96E29 417 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC74BQ96LY2 380 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 C5AR2Q9P296 337 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 RPS6KA6Q9UK32 745 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PR48 441 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM150CB9EJG8 249 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 CPN2P22792 545 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 RPL3P39023 403 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 PSPHP78330 225 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 MPEG1Q2M385 716 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 TCTE1Q5JU00 501 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ZBTB37Q5TC79 503 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 SAXO2Q658L1 398 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 PTOV1Q86YD1 416 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 CRELD1Q96HD1 420 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 DPYSL5Q9BPU6 564 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 CIB4A0PJX0 185 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 D6RAR5 112 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 B3GALT2O43825 422 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 GP1BAP07359 652 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ICAM2P13598 275 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 RUNX1T1Q06455 604 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 RUNX2Q13950 521 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 FAHD1Q6P587 224 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM65Q6PI78 240 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF367Q7RTV3 350 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 LHFPL5Q8TAF8 219 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 SPATA9Q9BWV2 254 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 KCNN2Q9H2S1 579 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 CMAHPQ9Y471 501 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 C4orf47A7E2U8 309 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 M0R129 80 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 AIFM1O95831 613 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 MSL3P1P0C860 447 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 GGT2P36268 569 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 RORCP51449 518 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 C18orf63Q68DL7 685 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 FAM180BQ6P0A1 224 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 CLECL1Q8IZS7 167 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 SHISA5Q8N114 240 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 OR1L3Q8NH93 324 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 MUC6Q6W4X9 2439 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 HYKKA2RU49 373 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 FITM1A5D6W6 292 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 LRP3O75074 770 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 SLC22A5O76082 557 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 PDE9AO76083 593 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 SSTR4P31391 388 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 SLITRK4Q8IW52 837 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 OR9A4Q8NGU2 314 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 TM9SF2Q99805 663 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 FAIM2Q9BWQ8 316 aa18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms