RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263966.7

USP13-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP13, Length 8,323 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-201ENST00000263966 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 PREBQ9HCU5 417 aa15.61■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 TMEM45AQ9NWC5 275 aa15.61■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 VDAC3Q9Y277 283 aa15.61■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa15.61■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 ZFAND1Q8TCF1 268 aa15.61■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 EVA1AQ9H8M9 152 aa15.61■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 CA3P07451 260 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 CLVS2Q5SYC1 327 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 CRTC1Q6UUV9 634 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 CMTM3Q96MX0 182 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 CCL11P51671 97 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 SCAPQ12770 1279 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 GPR50Q13585 617 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 KRBOX4Q5JUW0 171 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 SULF2Q8IWU5 870 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 NICN1Q9BSH3 213 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 RHCGQ9UBD6 479 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 H3BQ06 376 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 ADAM23O75077 832 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 PPP5CP53041 499 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 AQP4P55087 323 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 TSPAN33Q86UF1 283 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 VWA5B2Q8N398 1253 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 CLEC4DQ8WXI8 215 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 RGPD5Q99666 1765 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 C10orf82Q8WW14 230 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 TRAPPC13A5PLN9 417 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 CKMT1AP12532 417 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 GATMP50440 423 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 ATG9BQ674R7 924 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 MS4A15Q8N5U1 240 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 RPH3ALQ9UNE2 315 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 NFKBIEO00221 500 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 MICAQ29983 383 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 MPEG1Q2M385 716 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 KANK2Q63ZY3 851 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 GJD2Q9UKL4 321 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 C20orf202A1L168 122 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 NPIPA7E9PJI5 369 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 NPIPA8P0DM63 369 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 RPS23P62266 143 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 SLC6A5Q9Y345 797 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 NME7Q9Y5B8 376 aa15.6■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 A0A1W2PPK0 400 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 SPANXN4Q5MJ08 99 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 LRCH3Q96II8 777 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 SLC23A2Q9UGH3 650 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 AMY2AP04746 511 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 BCKDHBP21953 392 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 PYCR1P32322 319 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 FRMPD2BQ6IN97 320 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 TMEM150AQ86TG1 271 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 OR6T1Q8NGN1 323 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 SULT1B1O43704 296 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 IL1RNP18510 177 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 TBC1D28Q2M2D7 210 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 SBSNQ6UWP8 590 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 KLHL9Q9P2J3 617 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 GALNT2Q10471 571 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 GNG12Q9UBI6 72 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 ZNF225Q9UK10 706 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 RFPL2O75678 378 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 CSN1S1P47710 185 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 ZNF321PQ8N8H1 164 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 FNDC9Q8TBE3 224 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 UHRF2Q96PU4 802 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 GPR22Q99680 433 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 SLC22A7Q9Y694 548 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 MMP12P39900 470 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 SOX3P41225 446 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 PTH2RP49190 550 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 DCDP81605 110 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 IL17AQ16552 155 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 ANKRD22Q5VYY1 191 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 TOMM40LQ969M1 308 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 RBPJLQ9UBG7 517 aa15.59■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 A0A1B0GV50 99 aa15.58■□□□□ 0.09
USP13-201ENST00000263966 KDELR2P33947 212 aa15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms